More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1955 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1955  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 		 414 aa  845    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118802  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  27.52 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  24 
 
 		 507 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  25.43 
 
 		 509 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  23.56 
 
 		 472 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  26.59 
 
 		 487 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  25.65 
 
 		 487 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  27.11 
 
 		 559 aa  116  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  27.11 
 
 		 487 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  27.11 
 
 		 559 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 468 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  26.83 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  27.74 
 
 		 487 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  27.11 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  27.11 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  28.57 
 
 		 487 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 		 498 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  25.84 
 
 		 499 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  24.45 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.6 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  27.03 
 
 		 500 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  26.4 
 
 		 500 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  26.07 
 
 		 500 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.35 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  27.68 
 
 		 569 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.76 
 
 		 497 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  22.73 
 
 		 494 aa  94.4  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  24.76 
 
 		 488 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  24.76 
 
 		 500 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.83 
 
 		 579 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  24.76 
 
 		 500 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  22.73 
 
 		 494 aa  94.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4653  hypothetical protein  26.17 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.465095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  25.92 
 
 		 500 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  24.29 
 
 		 540 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  24.31 
 
 		 575 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  24.31 
 
 		 575 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  24.31 
 
 		 575 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  25.37 
 
 		 575 aa  90.5  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  25.37 
 
 		 575 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  21.52 
 
 		 506 aa  90.5  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  24.43 
 
 		 540 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  24.43 
 
 		 540 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  27.73 
 
 		 564 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  25.77 
 
 		 558 aa  90.1  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  24.15 
 
 		 372 aa  90.1  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  25.37 
 
 		 575 aa  89.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  25.87 
 
 		 576 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0580  AMP-binding domain protein  25.57 
 
 		 576 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.566618  normal  0.942666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  24.49 
 
 		 564 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  24.1 
 
 		 579 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  23.4 
 
 		 571 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  27 
 
 		 577 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  24.11 
 
 		 542 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  25.99 
 
 		 539 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  27 
 
 		 577 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1049  AMP-dependent synthetase and ligase  24.66 
 
 		 495 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.85 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  27 
 
 		 574 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2952  AMP-dependent synthetase and ligase  24.32 
 
 		 541 aa  87  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  24.7 
 
 		 487 aa  86.3  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  24.31 
 
 		 575 aa  86.7  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  23.12 
 
 		 1043 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.6 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  21.14 
 
 		 991 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  24.7 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  21.35 
 
 		 539 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  23.68 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  24.84 
 
 		 564 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  23.7 
 
 		 538 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  25.16 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  23.39 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  23.55 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  23.12 
 
 		 576 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1489  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.63 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.149782  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  22.69 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  23.74 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.48 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1773  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.79 
 
 		 555 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.010407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  23.77 
 
 		 576 aa  83.6  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2629  rfbL protein  24.57 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  23.58 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2807  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.1 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  hitchhiker  0.00838835 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  23.58 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  23.58 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  23.58 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  21.49 
 
 		 509 aa  82.4  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  23.58 
 
 		 576 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  25.54 
 
 		 576 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  23.58 
 
 		 570 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  23.71 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  24.06 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 		 562 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  23.91 
 
 		 578 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  24.03 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  23.23 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>