More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1021 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
447 aa  877    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325725  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2233  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  40.09 
 
 
479 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788177  normal  0.216177 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 
448 aa  286  4e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0919  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.74 
 
 
451 aa  272  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.89 
 
 
463 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4067  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.64 
 
 
471 aa  268  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846169  unclonable  0.0000722409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1206  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.53 
 
 
479 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1235  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.81 
 
 
479 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139768  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2807  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.58 
 
 
386 aa  206  5e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  hitchhiker  0.00838835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 
490 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.83 
 
 
500 aa  153  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.22 
 
 
513 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02491  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  30.9 
 
 
411 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2117  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.91 
 
 
388 aa  146  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.605714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.55 
 
 
528 aa  143  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.88 
 
 
492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2436  O-succinylbenzoate--CoA ligase  37.86 
 
 
388 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.96 
 
 
474 aa  139  7e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1542  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  29.39 
 
 
411 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357334  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 
383 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27321  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  34.12 
 
 
411 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.982291 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.33 
 
 
453 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 
382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.68 
 
 
486 aa  133  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.37 
 
 
473 aa  133  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.67 
 
 
494 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.38 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.1 
 
 
490 aa  130  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.76 
 
 
482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  29.86 
 
 
504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.95 
 
 
510 aa  130  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.38 
 
 
392 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.89 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.41 
 
 
482 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.74 
 
 
482 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.41 
 
 
482 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.41 
 
 
482 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.41 
 
 
481 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  28.71 
 
 
507 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.56 
 
 
498 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  29.89 
 
 
510 aa  126  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  29.89 
 
 
510 aa  126  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  29.59 
 
 
510 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.06 
 
 
481 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  31.82 
 
 
512 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  31.6 
 
 
506 aa  125  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.17 
 
 
459 aa  125  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.41 
 
 
482 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  31.48 
 
 
503 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.06 
 
 
481 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 
561 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  32.34 
 
 
501 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.06 
 
 
481 aa  123  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  31.7 
 
 
504 aa  123  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.3 
 
 
479 aa  123  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  30.92 
 
 
504 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  28.12 
 
 
490 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.29 
 
 
556 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 
487 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  32.04 
 
 
501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  29.24 
 
 
511 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  31.25 
 
 
504 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.18 
 
 
556 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01921  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  26.53 
 
 
414 aa  120  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.18 
 
 
556 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.41 
 
 
492 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.41 
 
 
492 aa  119  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 
501 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
502 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  30.79 
 
 
509 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.72 
 
 
519 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 
491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 
491 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 
526 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  26.49 
 
 
491 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  30.26 
 
 
506 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.49 
 
 
526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  31.37 
 
 
530 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.14 
 
 
525 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  30.37 
 
 
504 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.87 
 
 
484 aa  117  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  29.07 
 
 
510 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.97 
 
 
563 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  25.76 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4061  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  29.8 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  26.42 
 
 
499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.46 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.17 
 
 
503 aa  114  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  29.53 
 
 
503 aa  114  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  29.47 
 
 
506 aa  114  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.87 
 
 
461 aa  113  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 
444 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  27.01 
 
 
504 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.46 
 
 
462 aa  113  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.03 
 
 
489 aa  112  9e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 
558 aa  113  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>