More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1542 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1542  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  100 
 
 
411 aa  833    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357334  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02491  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  90.75 
 
 
411 aa  772    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01921  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  40.2 
 
 
414 aa  336  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27321  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  38.37 
 
 
411 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.982291 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2436  O-succinylbenzoate--CoA ligase  39.74 
 
 
388 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2117  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.82 
 
 
388 aa  279  6e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.605714  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0176  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  39.95 
 
 
404 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.671495  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01921  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  40.21 
 
 
400 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491044  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01941  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  40 
 
 
400 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.402847  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02031  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  39.22 
 
 
402 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.270943  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.36 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325725  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 
448 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0919  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.86 
 
 
451 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4067  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.32 
 
 
471 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846169  unclonable  0.0000722409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.97 
 
 
463 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2807  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.35 
 
 
386 aa  119  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  hitchhiker  0.00838835 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.64 
 
 
480 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2233  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.4 
 
 
479 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788177  normal  0.216177 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1206  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.56 
 
 
479 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.84 
 
 
451 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.74 
 
 
451 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1235  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.39 
 
 
479 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139768  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  29.84 
 
 
451 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.84 
 
 
451 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.84 
 
 
451 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.84 
 
 
451 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  29.84 
 
 
451 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.66 
 
 
453 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.48 
 
 
455 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285038  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3402  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.51 
 
 
451 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.671399  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.08 
 
 
451 aa  103  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2441  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.43 
 
 
455 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2533  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.43 
 
 
455 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2545  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.43 
 
 
455 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.74544  normal  0.782551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.88 
 
 
481 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.63 
 
 
481 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.87 
 
 
489 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2649  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.48 
 
 
455 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.479728  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.38 
 
 
473 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.15 
 
 
482 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.21 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.88 
 
 
482 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.38 
 
 
482 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.61 
 
 
482 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.61 
 
 
482 aa  98.6  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1486  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.1 
 
 
471 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.27 
 
 
510 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.34 
 
 
482 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.34 
 
 
481 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.34 
 
 
345 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1207  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.56 
 
 
468 aa  96.3  8e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.36 
 
 
500 aa  96.3  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  25.15 
 
 
372 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.34 
 
 
481 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.35 
 
 
474 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1781  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.78 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.353242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.47 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1593  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.78 
 
 
471 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.07 
 
 
477 aa  94.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1115  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.35 
 
 
487 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.07 
 
 
392 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  23.05 
 
 
513 aa  93.2  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.49 
 
 
462 aa  93.2  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.95 
 
 
485 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.08 
 
 
492 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 
396 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.45 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.22 
 
 
484 aa  90.5  5e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  23.75 
 
 
381 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3199  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.39 
 
 
470 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  24.29 
 
 
486 aa  90.1  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 
382 aa  89.7  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.81 
 
 
482 aa  89.7  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1882  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.95 
 
 
480 aa  89  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.86 
 
 
479 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24190  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.29 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.15 
 
 
459 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.68 
 
 
490 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.41 
 
 
495 aa  87  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 
385 aa  87  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.18 
 
 
482 aa  86.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.17 
 
 
478 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1103  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.51 
 
 
465 aa  85.5  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  26.67 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  24.77 
 
 
502 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  24.6 
 
 
524 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8226  AMP-dependent synthetase and ligase  25.29 
 
 
515 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198543  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  24.43 
 
 
515 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  24.83 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  24.56 
 
 
498 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  22.99 
 
 
545 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  26.5 
 
 
490 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  24.53 
 
 
502 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3146  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 
533 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683024  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01433  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.41 
 
 
483 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  22.46 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.51 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  23.66 
 
 
512 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  24.19 
 
 
528 aa  80.1  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>