More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0033 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
361 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  81.1 
 
 
345 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  71.55 
 
 
354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  71.55 
 
 
354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  71.26 
 
 
354 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10553  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  65.04 
 
 
362 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288871  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  60.22 
 
 
381 aa  363  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  53.04 
 
 
372 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  46.47 
 
 
392 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4564  AMP-dependent synthetase and ligase  48.88 
 
 
386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517085  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6700  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 
353 aa  238  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  48.49 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07270  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  45.53 
 
 
394 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.617796  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  45.23 
 
 
382 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  45.97 
 
 
434 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0451  AMP-dependent synthetase and ligase  42.01 
 
 
428 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  49.27 
 
 
396 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24160  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  45.24 
 
 
384 aa  209  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.907665  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0508  AMP-dependent synthetase and ligase  45.77 
 
 
333 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000453063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0637  AMP-dependent synthetase and ligase  53.08 
 
 
394 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0528  AMP-dependent synthetase and ligase  39.09 
 
 
366 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0161843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  42.66 
 
 
391 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  43.49 
 
 
381 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  45.17 
 
 
385 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  43.18 
 
 
444 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17900  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  46.4 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3247  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  47.02 
 
 
392 aa  182  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4018  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  45.55 
 
 
391 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443755  normal  0.0433462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  40.65 
 
 
486 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35.17 
 
 
492 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 
430 aa  162  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.36 
 
 
490 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35 
 
 
481 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  35 
 
 
482 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.71 
 
 
481 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.31 
 
 
482 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.12 
 
 
482 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.31 
 
 
482 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.6 
 
 
481 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.72 
 
 
481 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.72 
 
 
482 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.02 
 
 
482 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.91 
 
 
481 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 
490 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.37 
 
 
513 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.93 
 
 
473 aa  145  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1628  AMP-dependent synthetase and ligase  39.32 
 
 
395 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 
526 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.56 
 
 
500 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 
662 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24190  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.04 
 
 
435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
495 aa  140  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.5 
 
 
498 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
507 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 
500 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.24 
 
 
484 aa  138  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
955 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 
527 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.21 
 
 
453 aa  136  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.54 
 
 
528 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.31 
 
 
519 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 
499 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.38 
 
 
501 aa  135  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 
520 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.68 
 
 
461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1000  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 
573 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00216584  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
502 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.55 
 
 
520 aa  133  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.91 
 
 
479 aa  133  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.36 
 
 
484 aa  132  7.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1015  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 
498 aa  132  9e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00519801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 
549 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 
499 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2192  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
588 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.899371  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.98 
 
 
463 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.52 
 
 
491 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 
493 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 
495 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.24 
 
 
530 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 
499 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506811  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.14 
 
 
513 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
548 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 
537 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  33.24 
 
 
508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2450  AMP-dependent synthetase and ligase  33.43 
 
 
517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 
493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 
561 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 
516 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.25 
 
 
555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 
518 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.82 
 
 
510 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
512 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0588  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.53 
 
 
478 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.791941  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
508 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 
530 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
525 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  30.25 
 
 
519 aa  127  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>