More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24160 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24160  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 
384 aa  718    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.907665  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  47.23 
 
 
345 aa  236  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  44.95 
 
 
372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  43.86 
 
 
392 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  45.69 
 
 
361 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  44.74 
 
 
381 aa  210  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  46.11 
 
 
383 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  46.47 
 
 
354 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  41.52 
 
 
382 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  46.31 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  46.31 
 
 
354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0451  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 
428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10553  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  43.1 
 
 
362 aa  192  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288871  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07270  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  42.4 
 
 
394 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.617796  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0508  AMP-dependent synthetase and ligase  40.64 
 
 
333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000453063  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6700  AMP-dependent synthetase and ligase  41.85 
 
 
353 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0528  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 
366 aa  179  8e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0161843 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  43.46 
 
 
396 aa  179  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  42.7 
 
 
434 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  41.25 
 
 
391 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24190  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.47 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 
381 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0637  AMP-dependent synthetase and ligase  41.86 
 
 
394 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3247  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  41.49 
 
 
392 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  38.98 
 
 
444 aa  159  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4564  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
386 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517085  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  41.4 
 
 
385 aa  156  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17900  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  41.71 
 
 
393 aa  153  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 
430 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.75 
 
 
513 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4018  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  40.23 
 
 
391 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443755  normal  0.0433462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
490 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.8 
 
 
498 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.86 
 
 
473 aa  123  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.18 
 
 
453 aa  119  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.11 
 
 
528 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.97 
 
 
525 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30 
 
 
510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.43 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.9 
 
 
480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
502 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.93 
 
 
451 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.09 
 
 
489 aa  106  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.37 
 
 
501 aa  106  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.86 
 
 
482 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
507 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.32 
 
 
527 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.29 
 
 
519 aa  103  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.73 
 
 
490 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2233  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.69 
 
 
479 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788177  normal  0.216177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.69 
 
 
526 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 
487 aa  101  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.23 
 
 
495 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.24 
 
 
463 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23 
 
 
484 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 
520 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 
561 aa  100  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.27 
 
 
525 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  29.78 
 
 
503 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.88 
 
 
491 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  34.23 
 
 
469 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.94 
 
 
482 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1882  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.86 
 
 
480 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  30.43 
 
 
507 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2052  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.78 
 
 
482 aa  97.8  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  35.8 
 
 
450 aa  97.4  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 
553 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
546 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
524 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 
554 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0910  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 
501 aa  97.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.860065 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  29.08 
 
 
506 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.75 
 
 
492 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 
555 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.14 
 
 
481 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 
520 aa  96.3  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1497  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 
690 aa  96.3  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 
548 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  28.83 
 
 
508 aa  95.9  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.28 
 
 
500 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 
499 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506811  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 
561 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.39 
 
 
530 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 
553 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  27.55 
 
 
544 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2924  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.11 
 
 
482 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.39 
 
 
482 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.11 
 
 
481 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  25.98 
 
 
504 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  24.35 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.29 
 
 
481 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2093  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.52 
 
 
485 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2938  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00848916  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.39 
 
 
482 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 
496 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 
564 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  30.67 
 
 
480 aa  94.4  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4067  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.48 
 
 
471 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846169  unclonable  0.0000722409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>