More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4067 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4067  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  100 
 
 
471 aa  964    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846169  unclonable  0.0000722409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  52.47 
 
 
463 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  50.79 
 
 
448 aa  461  9.999999999999999e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1235  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  52.61 
 
 
479 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139768  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1206  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  52.93 
 
 
479 aa  445  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0919  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  53.99 
 
 
451 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2233  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  51.36 
 
 
479 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788177  normal  0.216177 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.64 
 
 
447 aa  259  7e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.325725  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2807  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.79 
 
 
386 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  hitchhiker  0.00838835 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.27 
 
 
528 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.77 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.17 
 
 
482 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.6 
 
 
481 aa  162  9e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.6 
 
 
482 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.6 
 
 
482 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.6 
 
 
481 aa  162  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.94 
 
 
500 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.33 
 
 
491 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.6 
 
 
482 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.31 
 
 
481 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.03 
 
 
490 aa  160  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.31 
 
 
482 aa  160  6e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.31 
 
 
482 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.93 
 
 
481 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.31 
 
 
481 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  28.72 
 
 
503 aa  157  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.65 
 
 
513 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.34 
 
 
492 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.77 
 
 
451 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.49 
 
 
494 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
430 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.33 
 
 
498 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.65 
 
 
510 aa  145  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
561 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.16 
 
 
453 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1847  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.05 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1883  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.05 
 
 
492 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2021  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.99 
 
 
479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3598  AMP-dependent synthetase and ligase  24.79 
 
 
578 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158457  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.67 
 
 
473 aa  139  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.81 
 
 
525 aa  139  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.03 
 
 
525 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1358  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.36 
 
 
474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0273591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.42 
 
 
525 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.81 
 
 
527 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  26.68 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  31.47 
 
 
509 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  25.8 
 
 
518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0176  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  31.18 
 
 
404 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.671495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 
508 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.95 
 
 
525 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  25.28 
 
 
502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  27.74 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  27.65 
 
 
546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 
508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  29.09 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 
499 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.54 
 
 
526 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 
515 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.88 
 
 
525 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  27.74 
 
 
546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 
508 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 
487 aa  130  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 
519 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2436  O-succinylbenzoate--CoA ligase  32.36 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  28.91 
 
 
504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  31.58 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  27.19 
 
 
559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.04 
 
 
510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  26.83 
 
 
544 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01921  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  28.49 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.491044  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  32.18 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.61 
 
 
512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 
517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  31.1 
 
 
510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  31.2 
 
 
503 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02491  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  29.59 
 
 
411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  26.92 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01921  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  27.68 
 
 
414 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.07 
 
 
489 aa  128  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0707  putative AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 
536 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.706357 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  27.54 
 
 
533 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.22 
 
 
526 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4698  AMP-dependent synthetase and ligase  24.43 
 
 
498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.796454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 
551 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 
372 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  26.34 
 
 
521 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  26.97 
 
 
559 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  26.97 
 
 
559 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  25.55 
 
 
518 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  26.81 
 
 
526 aa  127  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 
518 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  26.7 
 
 
487 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  24.07 
 
 
518 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01941  putative O-succinylbenzoic acid--CoA ligase (OSB-CoA synthetase)  28.68 
 
 
400 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.402847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>