More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2200 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2200  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 546 aa  1113    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1673  AMP-dependent synthetase and ligase  80.95 
 
 		 547 aa  944    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000119129 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0638  AMP-dependent synthetase and ligase  82.78 
 
 		 548 aa  976    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.00000118865  hitchhiker  0.000070168 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  44.49 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.86 
 
 		 548 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.181107  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2807  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.83 
 
 		 546 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.988252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.55 
 
 		 546 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0676  AMP-dependent synthetase and ligase  41.96 
 
 		 537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2062  AMP-dependent synthetase and ligase  40.71 
 
 		 546 aa  398  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.754742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0619  AMP-dependent synthetase and ligase  43.24 
 
 		 546 aa  395  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.26704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2999  AMP-dependent synthetase and ligase  40.38 
 
 		 563 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1388  AMP-dependent synthetase and ligase  43.57 
 
 		 547 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603254  normal  0.795615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0256  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.52 
 
 		 548 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.90557  normal  0.230564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0229  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.42 
 
 		 550 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1148  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.35 
 
 		 560 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.5 
 
 		 560 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.69 
 
 		 560 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.439091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0791  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.19 
 
 		 560 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.943967  normal  0.278537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2120  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.25 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.182851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  40.39 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3416  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.55 
 
 		 545 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.81 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0862635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2199  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.8 
 
 		 548 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2020  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43 
 
 		 548 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00014741  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3048  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 		 554 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.865355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0805  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.81 
 
 		 560 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3661  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.04 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4425  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.62 
 
 		 560 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 544 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1168  medium chain acyl-CoA ligase  38.76 
 
 		 564 aa  375  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4347  AMP-dependent synthetase and ligase  40.38 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0896  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.74 
 
 		 552 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0104602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5832  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1237  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 564 aa  365  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.48061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1718  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 		 548 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0767981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 559 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.046587  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1081  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 556 aa  365  1e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267456 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0990  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.06 
 
 		 560 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.784735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  39.28 
 
 		 556 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.3339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0898  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  38.88 
 
 		 556 aa  363  6e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.586497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7172  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361996  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 544 aa  362  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  38.53 
 
 		 549 aa  359  8e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4709  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.26 
 
 		 560 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 		 537 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2146  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 548 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 553 aa  356  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0319  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 552 aa  354  2e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.570392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 537 aa  352  7e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 537 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.73 
 
 		 537 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 537 aa  350  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.55 
 
 		 537 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  39.13 
 
 		 538 aa  349  6e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 		 537 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4961  AMP-dependent synthetase and ligase  40.93 
 
 		 586 aa  346  8e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  38.73 
 
 		 545 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 549 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 		 533 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1267  putative acyl-CoA synthetase  36.45 
 
 		 542 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531202  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 547 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  39.64 
 
 		 551 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  37.39 
 
 		 542 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 543 aa  340  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 		 546 aa  340  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 		 545 aa  339  5.9999999999999996e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1165  putative acyl-CoA synthetase  36.46 
 
 		 542 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431504  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 546 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.93 
 
 		 541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4293  putative acyl-CoA synthetase  36.71 
 
 		 542 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0244741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 539 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 		 542 aa  333  3e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 550 aa  334  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  36.27 
 
 		 546 aa  333  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 565 aa  333  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 558 aa  333  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4934  putative acyl-CoA synthetase  35.48 
 
 		 542 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.115365  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.43 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.43 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.43 
 
 		 543 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 		 551 aa  331  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.43 
 
 		 536 aa  330  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 		 540 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2141  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.93 
 
 		 589 aa  330  4e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0380  putative acyl-CoA synthetase  36.5 
 
 		 545 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0617  putative acyl-CoA synthetase  37.27 
 
 		 534 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 544 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.23 
 
 		 542 aa  329  8e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.87 
 
 		 558 aa  329  8e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2557  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 555 aa  329  8e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1799  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.4 
 
 		 547 aa  329  9e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.72 
 
 		 542 aa  329  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.41 
 
 		 542 aa  329  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 527 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 		 545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.78 
 
 		 545 aa  327  3e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>