More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0637 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0637  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
394 aa  732    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.170359  hitchhiker  0.000367137 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0940  AMP-dependent synthetase and ligase  55.16 
 
 
434 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.673976  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2727  AMP-dependent synthetase and ligase  57.83 
 
 
383 aa  290  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.796759  normal  0.107189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  52.16 
 
 
372 aa  275  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  48.82 
 
 
382 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  50.51 
 
 
381 aa  262  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  52.77 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  47.94 
 
 
392 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  51.66 
 
 
354 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  51.38 
 
 
354 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  51.38 
 
 
354 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6700  AMP-dependent synthetase and ligase  53.27 
 
 
353 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  53.04 
 
 
361 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  46.8 
 
 
391 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07270  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  50.85 
 
 
394 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.617796  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4564  AMP-dependent synthetase and ligase  48.94 
 
 
386 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.517085  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  48.76 
 
 
381 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3078  AMP-dependent synthetase and ligase  43.67 
 
 
396 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2568  AMP-dependent synthetase and ligase  47.51 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.087074 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  45 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0508  AMP-dependent synthetase and ligase  48.64 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000453063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10553  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  48.13 
 
 
362 aa  205  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.288871  normal  0.216027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3247  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  52.21 
 
 
392 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0451  AMP-dependent synthetase and ligase  45.43 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4018  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  52.47 
 
 
391 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443755  normal  0.0433462 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0528  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 
366 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0161843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24160  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  46.02 
 
 
384 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.907665  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17900  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  50.57 
 
 
393 aa  193  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24190  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.69 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.86 
 
 
513 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04130  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.17 
 
 
501 aa  139  7e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.832077  normal  0.723137 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 
430 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.3 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.94 
 
 
477 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1392  AMP-dependent synthetase and ligase  27.71 
 
 
448 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.786578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  38.4 
 
 
450 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.43 
 
 
498 aa  123  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.73 
 
 
486 aa  122  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.98 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.01 
 
 
491 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.92 
 
 
481 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.97 
 
 
480 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
955 aa  119  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 
500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.66 
 
 
492 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28 
 
 
453 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  34.88 
 
 
480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2079  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.86 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.359284 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.77 
 
 
510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.69 
 
 
500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.06 
 
 
481 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.92 
 
 
482 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0888  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.23 
 
 
473 aa  114  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 
493 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.77 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  30.89 
 
 
508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.78 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.34 
 
 
461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.06 
 
 
481 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.77 
 
 
481 aa  113  5e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  31.88 
 
 
523 aa  113  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 
561 aa  113  8.000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.47 
 
 
512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 
571 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.77 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3552  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 
550 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  27.45 
 
 
503 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1185  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 
569 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.609931 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.53 
 
 
453 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.77 
 
 
482 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 
507 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14010  o-succinylbenzoic acid synthetase  29.32 
 
 
1027 aa  111  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 
527 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0326  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.35 
 
 
495 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.013654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 
526 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32 
 
 
451 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.89 
 
 
528 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0280  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.7 
 
 
484 aa  109  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 
496 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.35 
 
 
482 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  31.69 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.69 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.69 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1015  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
498 aa  109  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00519801 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  31.69 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.31 
 
 
451 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.69 
 
 
451 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1628  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
395 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.31 
 
 
451 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
491 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 
520 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 
577 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2233  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.92 
 
 
479 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788177  normal  0.216177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
502 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.79 
 
 
514 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1672  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.27 
 
 
489 aa  106  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>