More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4653 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4653  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  699    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.465095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  47.32 
 
 		 459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  43.13 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 472 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 498 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 468 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 501 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  29.36 
 
 		 504 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  29.49 
 
 		 504 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  31.01 
 
 		 518 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  30.64 
 
 		 504 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  31.05 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  25.68 
 
 		 487 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  30.14 
 
 		 504 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.21 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  25.38 
 
 		 487 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  30.79 
 
 		 510 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 504 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  24.86 
 
 		 559 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3010  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.19 
 
 		 462 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  25.6 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  25.14 
 
 		 559 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  31.44 
 
 		 509 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 430 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  25 
 
 		 487 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.78 
 
 		 549 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  30.52 
 
 		 503 aa  98.6  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  24.86 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  31.85 
 
 		 507 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  32.84 
 
 		 4930 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 2374 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  30.43 
 
 		 510 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  29.46 
 
 		 503 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  26.39 
 
 		 552 aa  97.1  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  31.11 
 
 		 2376 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  29.26 
 
 		 506 aa  97.1  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  28.78 
 
 		 505 aa  96.7  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 534 aa  96.3  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  27.09 
 
 		 506 aa  96.7  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  29.55 
 
 		 508 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 507 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  28.36 
 
 		 511 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  31.32 
 
 		 509 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  31.71 
 
 		 4575 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  30.65 
 
 		 501 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  28.44 
 
 		 504 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  24.12 
 
 		 559 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3279  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.45 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  29.28 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.78 
 
 		 345 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  24.58 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  26.77 
 
 		 384 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1955  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.69 
 
 		 414 aa  94.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 508 aa  94.4  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  30.36 
 
 		 506 aa  93.6  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  27.7 
 
 		 503 aa  93.2  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 502 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  28.36 
 
 		 503 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2636  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.82 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.737592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  31.17 
 
 		 501 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1557  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 476 aa  92  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 		 525 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  31.34 
 
 		 507 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0189  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.2 
 
 		 465 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.582963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  28.26 
 
 		 542 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  25.98 
 
 		 487 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 		 507 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  27.67 
 
 		 546 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 509 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  34.06 
 
 		 469 aa  90.1  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3199  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.5 
 
 		 470 aa  90.1  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  28.11 
 
 		 548 aa  90.1  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.95 
 
 		 486 aa  90.1  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 		 514 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 381 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  27.81 
 
 		 546 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  22.46 
 
 		 453 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 5154 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  31.32 
 
 		 502 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  28.11 
 
 		 548 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  29.62 
 
 		 504 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 500 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 500 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.81 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  27.63 
 
 		 512 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 500 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  27.17 
 
 		 547 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  26.67 
 
 		 543 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.57 
 
 		 547 aa  87.8  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 520 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 527 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.61 
 
 		 475 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>