More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3072 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 372 aa  711    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5455  hypothetical protein  44.44 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4653  hypothetical protein  43.13 
 
 		 371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.465095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1851  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 468 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000851454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2517  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 459 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.570913  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1008  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 472 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4677  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 507 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.65065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 506 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4735  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 509 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.660645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 468 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.03963  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1955  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.15 
 
 		 414 aa  90.1  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.118802  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0500  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 498 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.178401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 490 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  21.74 
 
 		 453 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3974  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.64 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4160  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.13 
 
 		 475 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0896552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1131  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.78 
 
 		 459 aa  79.3  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0872798  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0598  AMP-dependent synthetase and ligase  21.26 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0612  AMP-dependent synthetase and ligase  21.26 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  24.14 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  26.82 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 521 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0520634  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0307  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.36 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0704  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  28.45 
 
 		 545 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0223  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.83 
 
 		 504 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0175  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.25 
 
 		 470 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00288334  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3647  acyl-CoA synthetase  23.8 
 
 		 487 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  32.07 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  23.88 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0176  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.86 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 525 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1103  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.98 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02187  O-succinylbenzoic acid-CoA ligase  27.54 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1397  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.54 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1049  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.94 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0676934  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1015  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00519801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  23.58 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02146  hypothetical protein  27.54 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1388  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.54 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29237  predicted protein  29.62 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2406  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.54 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572521  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4291  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.25 
 
 		 475 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0973895  normal  0.0104756 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  23.58 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0307  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 571 aa  73.9  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0610213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  25.84 
 
 		 546 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2556  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.25 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.913886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3968  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.57 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  30.11 
 
 		 4575 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2639  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.27 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0253508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  23.74 
 
 		 487 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.91 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.91 
 
 		 497 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 520 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3402  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.25 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.671399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  26.22 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6637  benzoate-coenzyme A ligase  27.86 
 
 		 533 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2948  benzoate-CoA ligase family  28.57 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178077  normal  0.340429 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  24.91 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  24.91 
 
 		 488 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  24.91 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  25.3 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.81 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 527 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.46 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2405  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  23.28 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  23.44 
 
 		 487 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3770  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.36 
 
 		 491 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1541  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2810  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.47 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  24.91 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  24.45 
 
 		 500 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2415  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.71 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.246068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  24.72 
 
 		 576 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4576  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase, putative  27.23 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 		 516 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  28.29 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  25 
 
 		 575 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  25 
 
 		 575 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  25 
 
 		 575 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3843  O-succinylbenzoate-CoA ligase  29.76 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.364848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 955 aa  69.7  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1408  putative ortho-succinylbenzoate-CoA synthetase  32.69 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 507 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  23.19 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  23.05 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 		 586 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2318  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  25.5 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  24.19 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  23.38 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 578 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>