More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4094 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4094  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
533 aa  1056    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1982  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 
482 aa  327  3e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1744  AMP-dependent synthetase and ligase  41.03 
 
 
488 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732751  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  41.03 
 
 
488 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1810  AMP-dependent synthetase and ligase  41.03 
 
 
488 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4362  AMP-dependent synthetase and ligase  39.64 
 
 
480 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0881  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 
499 aa  310  4e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4558  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 
511 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
486 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5064  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 
502 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1694  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
499 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4874  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
504 aa  229  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4491  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
504 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4578  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
504 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.261387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
506 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 
507 aa  163  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
508 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 
503 aa  156  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 
523 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.454538  normal  0.0173498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  28.16 
 
 
503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0520634  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
523 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 
559 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  28.93 
 
 
500 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 
497 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 
511 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.04 
 
 
491 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4263  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 
502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.427818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 
521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 
565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
512 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.85 
 
 
526 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 
523 aa  146  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 
523 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 
517 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.79 
 
 
525 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.4 
 
 
519 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2033  2-aminobenzoate-CoA ligase  30.42 
 
 
541 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.951217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 
512 aa  144  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 
505 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.53 
 
 
525 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3828  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 
504 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3902  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 
504 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3814  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 
504 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 
508 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1935  acetyl-CoA synthetase, putative  30.44 
 
 
541 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.2 
 
 
481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 
509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 
585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 
532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 
502 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0025  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  28.07 
 
 
497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.98 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0744  2-aminobenzoate-CoA ligase  30.22 
 
 
541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.16 
 
 
526 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  32.69 
 
 
553 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0653  2-aminobenzoate-CoA ligase  30.22 
 
 
541 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 
509 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.84 
 
 
482 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3041  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 
511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.53 
 
 
525 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.41 
 
 
527 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.6 
 
 
513 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.2 
 
 
481 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  22.75 
 
 
518 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 
510 aa  140  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 
524 aa  140  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 
510 aa  139  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 
584 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 
523 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.78 
 
 
525 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 
534 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 
516 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 
517 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 
517 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.85 
 
 
482 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.85 
 
 
482 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1097  AMP-dependent synthetase and ligase  26.55 
 
 
576 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 
498 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.85 
 
 
481 aa  139  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 
525 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.7 
 
 
490 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 
549 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.7 
 
 
481 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.65 
 
 
482 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 
499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 
578 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 
561 aa  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 
510 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 
499 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 
561 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1530  AMP-dependent synthetase and ligase  26.23 
 
 
522 aa  136  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0910104 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  24.45 
 
 
482 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 
546 aa  136  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.57 
 
 
563 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.48 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.57 
 
 
563 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 
571 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.67437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>