More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2070 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 486 aa  948    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5064  AMP-dependent synthetase and ligase  44.31 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4491  AMP-dependent synthetase and ligase  44.82 
 
 		 504 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4578  AMP-dependent synthetase and ligase  44.82 
 
 		 504 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.261387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4874  AMP-dependent synthetase and ligase  44.82 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1694  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 499 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0881  AMP-dependent synthetase and ligase  40.79 
 
 		 499 aa  299  9e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1744  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 		 488 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 		 488 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1810  AMP-dependent synthetase and ligase  39.61 
 
 		 488 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1982  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 482 aa  279  7e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 533 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4558  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 511 aa  267  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4362  AMP-dependent synthetase and ligase  39.41 
 
 		 480 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 552 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  26.01 
 
 		 583 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  25.19 
 
 		 566 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  26.25 
 
 		 539 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 		 559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  24.33 
 
 		 557 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 561 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 573 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 508 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 564 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4237  dicarboxylate/CoA ligase PimA  28.24 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 561 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 506 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  24.22 
 
 		 543 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.72 
 
 		 585 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.02 
 
 		 527 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  25.24 
 
 		 511 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 521 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0520634  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 506 aa  134  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  23.79 
 
 		 583 aa  134  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 517 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 553 aa  133  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  27.77 
 
 		 550 aa  133  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5284  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  23.67 
 
 		 662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 		 500 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  23.6 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.13 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  30.9 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  26.72 
 
 		 541 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 		 490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  24.71 
 
 		 509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 		 584 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 		 512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 		 506 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 520 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 520 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  27.06 
 
 		 522 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  25.5 
 
 		 523 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 		 585 aa  129  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 510 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  25.62 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  26.94 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.36 
 
 		 582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  28.14 
 
 		 510 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.28 
 
 		 563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7073  putative pimeloyl-CoA ligase pimA  26.85 
 
 		 553 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.28 
 
 		 563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  28.39 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.36 
 
 		 561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  25.1 
 
 		 495 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  23.54 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.28 
 
 		 582 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  24.95 
 
 		 499 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.36 
 
 		 561 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  24.32 
 
 		 500 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  24.32 
 
 		 500 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6473  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 572 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  24.32 
 
 		 488 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 		 564 aa  128  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 		 518 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 545 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.8 
 
 		 561 aa  128  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 587 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0889  AMP-dependent synthetase and ligase  26.46 
 
 		 560 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0278278 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.28 
 
 		 563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  25.49 
 
 		 516 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.11 
 
 		 497 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.28 
 
 		 563 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 499 aa  127  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.17 
 
 		 561 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 520 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  27.98 
 
 		 534 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>