More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1982 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4362  AMP-dependent synthetase and ligase  76.2 
 
 		 480 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1982  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 482 aa  958    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1744  AMP-dependent synthetase and ligase  66.87 
 
 		 488 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  66.87 
 
 		 488 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1810  AMP-dependent synthetase and ligase  66.87 
 
 		 488 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4094  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 		 533 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0881  AMP-dependent synthetase and ligase  40.49 
 
 		 499 aa  327  3e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4558  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 		 511 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 486 aa  269  8e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5064  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 502 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1694  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4491  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4874  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4578  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.261387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 506 aa  192  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 511 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 508 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 506 aa  167  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 514 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 566 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.6 
 
 		 512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 499 aa  163  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.7 
 
 		 563 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 532 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.33 
 
 		 563 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.52 
 
 		 582 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.27 
 
 		 561 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.27 
 
 		 519 aa  160  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 525 aa  160  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 521 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0520634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.93 
 
 		 570 aa  160  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.9 
 
 		 518 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.7 
 
 		 561 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.89 
 
 		 563 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.89 
 
 		 563 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.81 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.61 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.81 
 
 		 556 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.89 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.81 
 
 		 556 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 507 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.35 
 
 		 579 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1015  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 498 aa  156  7e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00519801 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 525 aa  156  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.89 
 
 		 662 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  30.35 
 
 		 514 aa  155  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  29.91 
 
 		 533 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  32.58 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  25.94 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  27.13 
 
 		 512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 525 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  30.31 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6473  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 572 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.19 
 
 		 561 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.93 
 
 		 525 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 520 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.35 
 
 		 513 aa  153  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.81 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  27.45 
 
 		 512 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.75 
 
 		 530 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4440  AMP-dependent synthetase and ligase  26.95 
 
 		 549 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 		 490 aa  152  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 515 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.14 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 552 aa  150  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3218  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 495 aa  150  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 516 aa  150  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 584 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3792  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.89 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 549 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 		 537 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  31.28 
 
 		 549 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 513 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  30.35 
 
 		 531 aa  147  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.03 
 
 		 561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.42 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.85 
 
 		 510 aa  147  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 		 557 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.81 
 
 		 510 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.01 
 
 		 510 aa  147  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  30.14 
 
 		 533 aa  147  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 564 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.42 
 
 		 510 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 505 aa  146  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  30.51 
 
 		 521 aa  146  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.81 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  32.12 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.81 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.55 
 
 		 525 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 497 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.59 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.822792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>