More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3218 on replicon NC_008036
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008036  Sala_3218  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 495 aa  1014    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 520 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.29 
 
 		 527 aa  220  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 525 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 532 aa  220  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 523 aa  219  7.999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 521 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 518 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 511 aa  213  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 587 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 519 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6839  acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189698  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.83 
 
 		 525 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.12 
 
 		 525 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 		 525 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2153  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 591 aa  206  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0250663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 518 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.62 
 
 		 525 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 551 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.6 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.87 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 540 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.72 
 
 		 526 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 515 aa  204  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  32.35 
 
 		 601 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 535 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.61 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 527 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.1 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.59 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.41 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 514 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 520 aa  200  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 509 aa  200  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 531 aa  199  7e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 582 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 		 500 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.44 
 
 		 525 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 501 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 539 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 503 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.32 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1028  putative AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0219794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.12 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 501 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 584 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  29.02 
 
 		 533 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  29.63 
 
 		 520 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 584 aa  196  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 531 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 534 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 518 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 500 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 524 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 518 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  29.54 
 
 		 518 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 508 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.35 
 
 		 524 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 525 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 518 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 512 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5071  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 496 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 508 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 517 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 511 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 630 aa  192  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.64 
 
 		 570 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 534 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 512 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 		 566 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.67 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  31.03 
 
 		 503 aa  190  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 518 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.42 
 
 		 531 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 518 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3722  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 511 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.58 
 
 		 585 aa  189  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  28.32 
 
 		 556 aa  189  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 		 516 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.1049  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.68 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 482 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>