More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5064 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1694  AMP-dependent synthetase and ligase  81.05 
 
 		 499 aa  763    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5064  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 502 aa  1008    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4874  AMP-dependent synthetase and ligase  66.6 
 
 		 504 aa  631  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.28695 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4491  AMP-dependent synthetase and ligase  66.19 
 
 		 504 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4578  AMP-dependent synthetase and ligase  66.19 
 
 		 504 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.261387 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  44.31 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0881  AMP-dependent synthetase and ligase  39.6 
 
 		 499 aa  303  6.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1744  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1810  AMP-dependent synthetase and ligase  39.59 
 
 		 488 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1982  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.93 
 
 		 533 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4558  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4362  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 480 aa  251  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0702  putative acyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.345543  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 553 aa  143  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  28.19 
 
 		 490 aa  136  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 511 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 507 aa  134  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2702  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 		 521 aa  133  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0520634  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 546 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.77 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 518 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.17 
 
 		 527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0265  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73102  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.33 
 
 		 561 aa  127  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 		 587 aa  127  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 519 aa  126  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 532 aa  126  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 		 566 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 533 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.95 
 
 		 561 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.14 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0381221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.07 
 
 		 525 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 582 aa  123  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 583 aa  123  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 561 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1674  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 		 482 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 		 496 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 517 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  26.14 
 
 		 488 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 509 aa  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  25.86 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  26.14 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.69 
 
 		 563 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.69 
 
 		 563 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.69 
 
 		 563 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 590 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  26.14 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.69 
 
 		 582 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  26.39 
 
 		 500 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.78 
 
 		 490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.4 
 
 		 525 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2941  AMP-dependent synthetase and ligase  24.68 
 
 		 573 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000307884  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.38 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.93 
 
 		 497 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.41 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506811  normal  0.147252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2077  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 		 549 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 843 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.49 
 
 		 525 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 563 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0494  AMP-dependent synthetase and ligase  24.19 
 
 		 552 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  25.67 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.86 
 
 		 526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.17 
 
 		 526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 497 aa  118  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 513 aa  118  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 534 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  30.66 
 
 		 539 aa  117  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  27.61 
 
 		 564 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1366  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.34 
 
 		 485 aa  116  8.999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.691182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 530 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 506 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7073  putative pimeloyl-CoA ligase pimA  26.72 
 
 		 553 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 		 500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 552 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  25.15 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.93 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  26.62 
 
 		 512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.41 
 
 		 526 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1399  AMP-dependent synthetase and ligase  23.94 
 
 		 559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  28.65 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0155  AMP-dependent synthetase and ligase  23.85 
 
 		 627 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 504 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>