More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0418 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  97.78 
 
 
586 aa  1001    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  94.2 
 
 
586 aa  922    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  70.1 
 
 
586 aa  716    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
586 aa  1113    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 
949 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  34.84 
 
 
852 aa  316  6e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  34.84 
 
 
936 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 
958 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 
958 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  35.77 
 
 
563 aa  309  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  35.95 
 
 
576 aa  306  7e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  36.13 
 
 
576 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 
942 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 
947 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  35.95 
 
 
573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  35.77 
 
 
576 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  35.77 
 
 
573 aa  302  1e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
962 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
603 aa  289  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 
584 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 
608 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  35.77 
 
 
585 aa  286  5e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
839 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  34.45 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  38.62 
 
 
4318 aa  273  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.29 
 
 
4317 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.88 
 
 
4336 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.18 
 
 
4342 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.54 
 
 
4317 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  35.79 
 
 
4342 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.05 
 
 
4317 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  37.54 
 
 
577 aa  266  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.32 
 
 
563 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  38.48 
 
 
3208 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.14 
 
 
1801 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.74 
 
 
546 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  34.81 
 
 
4317 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.51 
 
 
4336 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  37.81 
 
 
601 aa  259  8e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  35.7 
 
 
1035 aa  259  1e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  37.77 
 
 
568 aa  258  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  35.55 
 
 
3235 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  34.65 
 
 
4332 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  35.09 
 
 
1776 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.8 
 
 
6403 aa  249  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 
578 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 
653 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 
1272 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  36.07 
 
 
1779 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.64 
 
 
1656 aa  246  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.8 
 
 
562 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.05 
 
 
2250 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  27.29 
 
 
581 aa  244  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
648 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  27.45 
 
 
581 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  32.39 
 
 
1067 aa  243  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  33.76 
 
 
1323 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 
595 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  37.18 
 
 
1699 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.63 
 
 
544 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  33.15 
 
 
3231 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  33.39 
 
 
1276 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  33.39 
 
 
1283 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  33.39 
 
 
1291 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.83 
 
 
1789 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
579 aa  233  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 
544 aa  233  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.62 
 
 
6889 aa  232  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
551 aa  233  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 
1292 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  31.62 
 
 
583 aa  231  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.09 
 
 
560 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  28.25 
 
 
3718 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  32.64 
 
 
2820 aa  227  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  34.46 
 
 
755 aa  227  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  29.58 
 
 
2791 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.7 
 
 
2762 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  32.97 
 
 
559 aa  226  7e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  30.31 
 
 
580 aa  226  7e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
701 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 
561 aa  226  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  34.93 
 
 
610 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  34.93 
 
 
610 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  34.06 
 
 
2721 aa  226  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  34.93 
 
 
599 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  34.93 
 
 
599 aa  226  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 
613 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  32.32 
 
 
576 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  30.78 
 
 
588 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  29.6 
 
 
597 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  37.02 
 
 
521 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  37.02 
 
 
521 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  37.02 
 
 
524 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  34.74 
 
 
599 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
991 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 
611 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 
600 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.16 
 
 
544 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.16 
 
 
544 aa  223  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  28.11 
 
 
614 aa  223  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>