More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3146 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  86.99 
 
 		 469 aa  793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 469 aa  916    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  58.89 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2982  acyl-CoA synthetase  60.66 
 
 		 498 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.186331  normal  0.190971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  58 
 
 		 468 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  62.06 
 
 		 466 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2175  acyl-CoA synthetase  58.33 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114298  normal  0.0918111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4522  acyl-CoA synthetase  59.21 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  54.45 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11217  acyl-CoA synthetase  58.71 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4020  acyl-CoA synthetase  61.07 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4095  acyl-CoA synthetase  61.07 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4250  acyl-CoA synthetase  61.07 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0676572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6551  acyl-CoA synthetase  55.38 
 
 		 450 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  52.68 
 
 		 478 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.904218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3491  acyl-CoA synthetase  51.11 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  42.94 
 
 		 553 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1436  AMP-dependent synthetase and ligase  48.09 
 
 		 488 aa  314  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313554  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  42.47 
 
 		 507 aa  290  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  41.87 
 
 		 502 aa  291  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 		 504 aa  286  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  38.13 
 
 		 512 aa  274  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 493 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 493 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  35.65 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 502 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  35.48 
 
 		 511 aa  251  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  34.21 
 
 		 507 aa  250  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  35.44 
 
 		 506 aa  249  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  42.36 
 
 		 526 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  38.11 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  38.43 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  34.76 
 
 		 504 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  41.83 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  38.2 
 
 		 506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  38.34 
 
 		 507 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  37.19 
 
 		 501 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  37.66 
 
 		 501 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  34.1 
 
 		 536 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 501 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  34.23 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  37.66 
 
 		 510 aa  236  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  38.19 
 
 		 510 aa  236  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  38.4 
 
 		 510 aa  236  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  34.52 
 
 		 500 aa  236  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  35.59 
 
 		 504 aa  234  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  34.82 
 
 		 504 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  37.05 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  34.02 
 
 		 519 aa  234  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  36.21 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  34.98 
 
 		 517 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.33 
 
 		 510 aa  229  6e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  34.11 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 510 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  33.81 
 
 		 511 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.78 
 
 		 510 aa  227  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  36.33 
 
 		 504 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 510 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  43.44 
 
 		 509 aa  227  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  34.99 
 
 		 506 aa  227  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  34.15 
 
 		 504 aa  227  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  36.03 
 
 		 517 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  35.01 
 
 		 508 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 510 aa  226  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 510 aa  226  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  34.63 
 
 		 539 aa  226  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.59 
 
 		 510 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 510 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  39.2 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.59 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  35.96 
 
 		 503 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  34.38 
 
 		 503 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.62 
 
 		 514 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.39 
 
 		 510 aa  223  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  32.94 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00562  peroxisomal AMP binding enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G11340)  38.48 
 
 		 533 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 500 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  39.82 
 
 		 504 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  36.14 
 
 		 485 aa  219  7.999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.86 
 
 		 512 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  35 
 
 		 518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  33.48 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 578 aa  213  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  35.79 
 
 		 509 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  33.75 
 
 		 547 aa  213  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.61 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.13 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 590 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 559 aa  204  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03230  long-chain acyl-CoA synthetase, putative  31.92 
 
 		 536 aa  201  3e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.295256  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 525 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 591 aa  200  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 499 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 561 aa  198  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 565 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>