More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3761 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 998 aa  1975    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  95.79 
 
 		 998 aa  1892    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  89.07 
 
 		 991 aa  1699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  50.36 
 
 		 577 aa  515  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  49.11 
 
 		 577 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  48.06 
 
 		 562 aa  497  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4394  acyl-CoA synthetase  59.33 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2300  acyl-CoA synthetase  57.72 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2630  acyl-CoA synthetase  57.18 
 
 		 421 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  41.25 
 
 		 615 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3524  acyl-CoA synthetase  46 
 
 		 433 aa  359  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12114  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.36 
 
 		 612 aa  319  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  31.39 
 
 		 612 aa  318  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  31.62 
 
 		 610 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  31.79 
 
 		 610 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  31.79 
 
 		 610 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  31.79 
 
 		 610 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  31.79 
 
 		 612 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  36.95 
 
 		 1148 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  32.76 
 
 		 613 aa  302  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  35.94 
 
 		 619 aa  299  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  33.77 
 
 		 618 aa  283  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  36.04 
 
 		 617 aa  278  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  36.52 
 
 		 1153 aa  270  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1846  acyl-CoA synthetase  35.52 
 
 		 412 aa  270  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.259612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2018  acyl-CoA synthetase  36.04 
 
 		 412 aa  268  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.75082e-44 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1840  acyl-CoA synthetase  36.29 
 
 		 412 aa  267  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1814  acyl-CoA synthetase  36.29 
 
 		 412 aa  267  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0396009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3344  acyl-CoA synthetase  35.61 
 
 		 412 aa  267  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  hitchhiker  0.0000000000000207537 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1983  acyl-CoA synthetase  36.29 
 
 		 412 aa  267  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1985  acyl-CoA synthetase  34.88 
 
 		 412 aa  266  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1797  acyl-CoA synthetase  35.38 
 
 		 412 aa  264  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  36.76 
 
 		 589 aa  253  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  26.02 
 
 		 592 aa  248  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  26.02 
 
 		 592 aa  248  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  32.97 
 
 		 594 aa  194  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  32.89 
 
 		 621 aa  189  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  29.63 
 
 		 597 aa  187  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  30.65 
 
 		 625 aa  180  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  30.71 
 
 		 596 aa  179  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  30.9 
 
 		 582 aa  177  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  32.48 
 
 		 577 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  33.08 
 
 		 615 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  29.28 
 
 		 635 aa  175  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  30.14 
 
 		 614 aa  172  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  32.97 
 
 		 580 aa  170  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  31.43 
 
 		 596 aa  169  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  32.61 
 
 		 580 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  30.52 
 
 		 582 aa  167  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30.52 
 
 		 582 aa  167  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  31.72 
 
 		 613 aa  165  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30.93 
 
 		 582 aa  166  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  27.63 
 
 		 642 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  27.47 
 
 		 642 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  27.96 
 
 		 642 aa  163  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  27.17 
 
 		 642 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 		 642 aa  160  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  24.5 
 
 		 629 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.81 
 
 		 604 aa  158  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  26.51 
 
 		 601 aa  157  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  24.51 
 
 		 631 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  29.68 
 
 		 842 aa  154  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  26.76 
 
 		 631 aa  154  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  26.57 
 
 		 604 aa  154  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  26.08 
 
 		 819 aa  153  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  27.34 
 
 		 607 aa  152  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  28.15 
 
 		 601 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  29.22 
 
 		 599 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  26.25 
 
 		 614 aa  145  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  22.63 
 
 		 813 aa  144  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.25 
 
 		 614 aa  144  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  25.11 
 
 		 615 aa  144  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  29.12 
 
 		 572 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  31.68 
 
 		 602 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  24.49 
 
 		 608 aa  137  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  33.02 
 
 		 799 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.72 
 
 		 578 aa  134  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  26.5 
 
 		 639 aa  134  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  28.54 
 
 		 621 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  30.27 
 
 		 563 aa  125  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 		 544 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  33.26 
 
 		 616 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6185  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 574 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  29.22 
 
 		 611 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0219  long chain fatty acid CoA ligase, putative  25.53 
 
 		 453 aa  111  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 569 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1052  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 566 aa  110  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.909575  hitchhiker  0.000208439 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  29.12 
 
 		 584 aa  108  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  28.6 
 
 		 4575 aa  108  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 		 549 aa  107  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 506 aa  105  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.53 
 
 		 557 aa  104  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  26.84 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.84 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.69 
 
 		 512 aa  104  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.84 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.84 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.84 
 
 		 561 aa  104  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  26.84 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  24.61 
 
 		 451 aa  103  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>