132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1654 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  81.98 
 
 
601 aa  1045    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  79.25 
 
 
629 aa  1058    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  79.97 
 
 
631 aa  1049    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  78.82 
 
 
631 aa  1048    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  98.75 
 
 
642 aa  1318    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  93.61 
 
 
642 aa  1237    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  97.82 
 
 
642 aa  1302    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  56.59 
 
 
604 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  98.29 
 
 
642 aa  1310    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  56.42 
 
 
604 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  60.1 
 
 
819 aa  756    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  100 
 
 
642 aa  1337    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  49.6 
 
 
842 aa  625  1e-177  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  53 
 
 
614 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  52.83 
 
 
614 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  50.26 
 
 
608 aa  600  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  48.85 
 
 
635 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  49.67 
 
 
625 aa  588  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  49.49 
 
 
613 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  48.55 
 
 
596 aa  578  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  48.21 
 
 
596 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  47.31 
 
 
597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  47.21 
 
 
594 aa  570  1e-161  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  47.89 
 
 
607 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  44.84 
 
 
602 aa  503  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  44.92 
 
 
799 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  39.53 
 
 
639 aa  439  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  37.56 
 
 
615 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  35.41 
 
 
601 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  35.18 
 
 
614 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  35.09 
 
 
813 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  32.74 
 
 
621 aa  306  7e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  33.15 
 
 
599 aa  306  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  31.35 
 
 
616 aa  273  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  29.37 
 
 
580 aa  272  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  29.68 
 
 
577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.19 
 
 
580 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  31.03 
 
 
621 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  29.91 
 
 
582 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  29.95 
 
 
615 aa  263  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.66 
 
 
582 aa  263  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.66 
 
 
582 aa  262  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  29.66 
 
 
582 aa  262  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  29.11 
 
 
572 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  27.41 
 
 
716 aa  227  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  27.32 
 
 
578 aa  226  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  25.22 
 
 
612 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  25.39 
 
 
610 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.39 
 
 
610 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  25.39 
 
 
610 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  25.39 
 
 
610 aa  219  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  27.79 
 
 
619 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.65 
 
 
612 aa  217  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.94 
 
 
612 aa  211  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  28.09 
 
 
618 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  28.93 
 
 
617 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  27.37 
 
 
589 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  23.17 
 
 
613 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  28.12 
 
 
1148 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  25.13 
 
 
1153 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.4 
 
 
998 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.47 
 
 
998 aa  162  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.55 
 
 
562 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.12 
 
 
991 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.51 
 
 
592 aa  151  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.51 
 
 
592 aa  151  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.36 
 
 
577 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  24.71 
 
 
577 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 
615 aa  127  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  23.08 
 
 
580 aa  107  9e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.3 
 
 
580 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  24.36 
 
 
633 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  20.78 
 
 
588 aa  92  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  24.06 
 
 
720 aa  82.4  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  22.49 
 
 
655 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  24.12 
 
 
575 aa  81.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  23.08 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  21.58 
 
 
655 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  21.85 
 
 
563 aa  77.4  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  23.47 
 
 
575 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  22.56 
 
 
610 aa  74.3  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  23.99 
 
 
578 aa  67.8  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  22.3 
 
 
610 aa  67.4  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  22.42 
 
 
637 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  19.69 
 
 
925 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  22.2 
 
 
599 aa  61.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  23.89 
 
 
587 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  23.72 
 
 
584 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  23.72 
 
 
584 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  25 
 
 
589 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  22.16 
 
 
606 aa  58.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  23.89 
 
 
557 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  23.6 
 
 
584 aa  57  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  22.89 
 
 
592 aa  57  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  21.85 
 
 
519 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  21.65 
 
 
576 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  22.88 
 
 
608 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  20.06 
 
 
580 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  21.99 
 
 
656 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  21.99 
 
 
656 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>