139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3462 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  55.42 
 
 
842 aa  650    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  58.78 
 
 
635 aa  704    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  72.13 
 
 
596 aa  869    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  66.11 
 
 
613 aa  779    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  100 
 
 
594 aa  1211    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  71.62 
 
 
596 aa  859    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  68.46 
 
 
597 aa  850    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  56.91 
 
 
625 aa  677    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  49.83 
 
 
608 aa  605  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  48.73 
 
 
614 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  48.56 
 
 
614 aa  597  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  48.72 
 
 
601 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  48.21 
 
 
631 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  47.53 
 
 
629 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  47.7 
 
 
631 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  47.38 
 
 
642 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  47.44 
 
 
642 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  47.44 
 
 
642 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  47.44 
 
 
642 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  47.27 
 
 
642 aa  568  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  45.14 
 
 
819 aa  564  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  46.18 
 
 
604 aa  561  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  45.99 
 
 
607 aa  558  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  46.01 
 
 
604 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  50.76 
 
 
602 aa  535  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  49.06 
 
 
799 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  38.31 
 
 
639 aa  445  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  39.97 
 
 
615 aa  434  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  33.39 
 
 
813 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  36.64 
 
 
601 aa  332  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  35.18 
 
 
614 aa  323  5e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  36.55 
 
 
599 aa  311  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  33.75 
 
 
621 aa  283  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  32.86 
 
 
621 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  35.13 
 
 
615 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  31.05 
 
 
580 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  36.41 
 
 
616 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  31.1 
 
 
577 aa  267  5e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  31.87 
 
 
582 aa  266  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  31.05 
 
 
580 aa  263  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30.43 
 
 
582 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30.43 
 
 
582 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  30.43 
 
 
582 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  33.19 
 
 
716 aa  241  4e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  27.12 
 
 
610 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  26.63 
 
 
610 aa  233  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.63 
 
 
610 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  26.63 
 
 
612 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  26.47 
 
 
610 aa  233  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  27.43 
 
 
578 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  27.88 
 
 
572 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.31 
 
 
612 aa  223  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  30.56 
 
 
619 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.98 
 
 
612 aa  220  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  29.7 
 
 
618 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  31.86 
 
 
991 aa  200  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  30.23 
 
 
617 aa  196  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  33.26 
 
 
998 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  32.97 
 
 
998 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  25.45 
 
 
613 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  30.38 
 
 
589 aa  187  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  29.77 
 
 
577 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  25.65 
 
 
1148 aa  170  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  29.84 
 
 
562 aa  170  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  27.24 
 
 
615 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  28.98 
 
 
577 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  25.09 
 
 
592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  25.09 
 
 
592 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  28.24 
 
 
1153 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  26.65 
 
 
633 aa  107  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  22.91 
 
 
580 aa  102  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  22.69 
 
 
580 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.74 
 
 
613 aa  95.5  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  20.38 
 
 
588 aa  92.4  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 
563 aa  87  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  24.08 
 
 
584 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  24.08 
 
 
584 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.07 
 
 
578 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.07 
 
 
578 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  23.61 
 
 
610 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  24.86 
 
 
601 aa  68.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  23.78 
 
 
611 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  26.38 
 
 
578 aa  67  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  23.22 
 
 
575 aa  67  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  23.88 
 
 
655 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  20.24 
 
 
653 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  22.98 
 
 
637 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  23.58 
 
 
655 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  21.02 
 
 
656 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  21.02 
 
 
656 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  22 
 
 
925 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  23.01 
 
 
575 aa  63.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  25.95 
 
 
519 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  25.66 
 
 
570 aa  60.8  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  23.37 
 
 
606 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  23.05 
 
 
610 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  28.02 
 
 
557 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  28.93 
 
 
585 aa  57.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  28.93 
 
 
585 aa  57.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  19.64 
 
 
585 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>