124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0594 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  100 
 
 
639 aa  1323    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  45.63 
 
 
615 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  41.46 
 
 
614 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  41.12 
 
 
614 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  40.64 
 
 
607 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  40.65 
 
 
813 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  37.98 
 
 
608 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  38.31 
 
 
594 aa  445  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  40 
 
 
601 aa  442  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  38.68 
 
 
596 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  39.53 
 
 
642 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  39.53 
 
 
642 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  39.53 
 
 
642 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  39.53 
 
 
642 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  39.36 
 
 
642 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  39.19 
 
 
597 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  38.28 
 
 
596 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  37.31 
 
 
819 aa  433  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  39.32 
 
 
614 aa  430  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  37.42 
 
 
635 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  39.06 
 
 
842 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  37.5 
 
 
625 aa  422  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  37.57 
 
 
601 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  37.21 
 
 
629 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  37.39 
 
 
631 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  37.03 
 
 
631 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  36.58 
 
 
613 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  37.42 
 
 
604 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  37.25 
 
 
604 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  36.49 
 
 
621 aa  395  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  37.67 
 
 
599 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  36.86 
 
 
602 aa  379  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  31.97 
 
 
621 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  32.64 
 
 
615 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  34.75 
 
 
799 aa  335  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  34.18 
 
 
616 aa  323  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  30.02 
 
 
582 aa  290  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  33.86 
 
 
572 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  30.55 
 
 
578 aa  276  6e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  27.81 
 
 
577 aa  267  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.57 
 
 
580 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.45 
 
 
582 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  28.45 
 
 
582 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.45 
 
 
582 aa  263  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  30.42 
 
 
716 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  27.71 
 
 
580 aa  257  6e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  27.87 
 
 
610 aa  239  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  27.98 
 
 
612 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  27.98 
 
 
610 aa  237  6e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.98 
 
 
610 aa  237  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  27.81 
 
 
610 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  31.53 
 
 
619 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.7 
 
 
612 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.53 
 
 
612 aa  229  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  29.96 
 
 
618 aa  221  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  27.66 
 
 
589 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.78 
 
 
1148 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  26.38 
 
 
613 aa  204  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  26.88 
 
 
617 aa  197  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  29.75 
 
 
592 aa  173  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  29.75 
 
 
592 aa  173  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  27.65 
 
 
562 aa  160  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.28 
 
 
615 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  25.4 
 
 
1153 aa  158  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26 
 
 
577 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  25.8 
 
 
577 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.71 
 
 
998 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  26.5 
 
 
998 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  28.25 
 
 
991 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.73 
 
 
580 aa  107  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  25.72 
 
 
580 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  24.48 
 
 
633 aa  95.9  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  21.92 
 
 
588 aa  92.8  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.46 
 
 
578 aa  87.4  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.46 
 
 
578 aa  87.4  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  24.32 
 
 
655 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  23.94 
 
 
655 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  23.75 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  22.22 
 
 
563 aa  78.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  22.56 
 
 
610 aa  76.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  21.99 
 
 
575 aa  75.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  20.99 
 
 
925 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  20.77 
 
 
575 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  22.84 
 
 
586 aa  73.2  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  21.91 
 
 
684 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  22.78 
 
 
610 aa  67.8  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  23.33 
 
 
580 aa  66.6  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  24.46 
 
 
606 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  21.82 
 
 
578 aa  65.1  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.6 
 
 
557 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  21.45 
 
 
611 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  22.01 
 
 
637 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  20 
 
 
576 aa  61.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  22.32 
 
 
720 aa  61.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  22.1 
 
 
584 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  23.77 
 
 
601 aa  57  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  22.22 
 
 
601 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  20.41 
 
 
584 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  20.41 
 
 
584 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.02 
 
 
653 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>