150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1808 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  100 
 
 
601 aa  1203    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  47.54 
 
 
578 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  42.25 
 
 
606 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  39.33 
 
 
645 aa  340  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  36.42 
 
 
672 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  41.29 
 
 
601 aa  331  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  40.95 
 
 
591 aa  322  9.999999999999999e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  34.05 
 
 
602 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  33.86 
 
 
602 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  34.05 
 
 
602 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  34.51 
 
 
602 aa  278  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  34.51 
 
 
602 aa  277  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  34.51 
 
 
602 aa  276  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  34.51 
 
 
602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  34.76 
 
 
602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  38.91 
 
 
594 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  38.28 
 
 
594 aa  260  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  33.23 
 
 
610 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  35.73 
 
 
593 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  38.36 
 
 
595 aa  257  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  31.91 
 
 
810 aa  250  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  30.32 
 
 
584 aa  248  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  34.81 
 
 
609 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  34.6 
 
 
596 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  29.52 
 
 
818 aa  227  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  30.15 
 
 
925 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  31.97 
 
 
588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  28.34 
 
 
560 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  27.97 
 
 
613 aa  181  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  29.77 
 
 
574 aa  180  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  29.82 
 
 
578 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  29.82 
 
 
578 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  30.92 
 
 
610 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  28.11 
 
 
574 aa  170  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  30.72 
 
 
1148 aa  170  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  28.12 
 
 
574 aa  169  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  31.28 
 
 
590 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  31.28 
 
 
590 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  29.03 
 
 
611 aa  160  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  31.5 
 
 
586 aa  157  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  27.14 
 
 
586 aa  154  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  29.61 
 
 
581 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  33.18 
 
 
1153 aa  147  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  30.65 
 
 
608 aa  143  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  31.43 
 
 
519 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  31.28 
 
 
599 aa  138  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  28.43 
 
 
584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  24.04 
 
 
580 aa  134  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  27.71 
 
 
576 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  31.76 
 
 
555 aa  124  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  25.51 
 
 
684 aa  124  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  27.98 
 
 
628 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  26.85 
 
 
594 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  28.31 
 
 
577 aa  94.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  27.31 
 
 
615 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  29.41 
 
 
991 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  29.18 
 
 
577 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  27.21 
 
 
720 aa  87.8  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.58 
 
 
582 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.58 
 
 
582 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  26.58 
 
 
582 aa  84.7  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  24.01 
 
 
572 aa  84  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.54 
 
 
580 aa  84  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.51 
 
 
580 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  28.89 
 
 
998 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  30.25 
 
 
655 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  28.74 
 
 
562 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  23.73 
 
 
588 aa  80.9  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  28.53 
 
 
582 aa  79.3  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  26.53 
 
 
998 aa  79  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  27.08 
 
 
610 aa  78.2  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  29.88 
 
 
655 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.86 
 
 
577 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  27.14 
 
 
621 aa  74.7  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.63 
 
 
656 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.63 
 
 
656 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  26.97 
 
 
563 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  25.54 
 
 
619 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.45 
 
 
587 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  25.37 
 
 
580 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  25.27 
 
 
842 aa  67.8  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  26.18 
 
 
635 aa  67.4  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  23.18 
 
 
601 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  23.14 
 
 
629 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  23.11 
 
 
580 aa  66.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  23.24 
 
 
653 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  26.61 
 
 
637 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  23.62 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  23.62 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  28.38 
 
 
640 aa  63.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  23.62 
 
 
612 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  29.19 
 
 
599 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.62 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  22.83 
 
 
602 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  26.61 
 
 
629 aa  62  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  24.79 
 
 
557 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  24.29 
 
 
578 aa  61.2  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  23.14 
 
 
631 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  25 
 
 
610 aa  60.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  23.79 
 
 
585 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>