113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2302 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  100 
 
 
609 aa  1243    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  78.6 
 
 
596 aa  915    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  72.44 
 
 
593 aa  842    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  54.06 
 
 
595 aa  591  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  53.32 
 
 
594 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  52.44 
 
 
594 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  43.99 
 
 
610 aa  458  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  36.5 
 
 
602 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  36.74 
 
 
602 aa  351  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  36.74 
 
 
602 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  36.27 
 
 
602 aa  350  6e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  36.9 
 
 
602 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  36.9 
 
 
602 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  36.74 
 
 
602 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  36.48 
 
 
602 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  37.27 
 
 
578 aa  309  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  37 
 
 
645 aa  309  8e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  35.09 
 
 
591 aa  309  8e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  37.58 
 
 
601 aa  306  7e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  33.28 
 
 
606 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  34.24 
 
 
584 aa  248  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  29.32 
 
 
810 aa  238  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  34.39 
 
 
601 aa  236  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  36.31 
 
 
588 aa  228  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  30.31 
 
 
925 aa  225  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  39.29 
 
 
570 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  30.79 
 
 
818 aa  204  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  30.17 
 
 
672 aa  203  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  27.81 
 
 
610 aa  192  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  27.74 
 
 
578 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  27.74 
 
 
578 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  27.17 
 
 
613 aa  177  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  35.23 
 
 
608 aa  170  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  29.79 
 
 
574 aa  170  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  30.41 
 
 
611 aa  170  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  29.77 
 
 
574 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  27.91 
 
 
586 aa  168  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  29.92 
 
 
574 aa  166  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  30.03 
 
 
584 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  27.01 
 
 
560 aa  163  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  25.36 
 
 
580 aa  163  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  30.5 
 
 
581 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  30.93 
 
 
590 aa  150  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  30.93 
 
 
590 aa  150  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  32.54 
 
 
555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  29.93 
 
 
576 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  29.19 
 
 
586 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  28.08 
 
 
1148 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  30.84 
 
 
1153 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  31.75 
 
 
519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  26.26 
 
 
684 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  29.09 
 
 
628 aa  130  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  25.04 
 
 
594 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  30.38 
 
 
599 aa  115  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  24.78 
 
 
720 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  29.27 
 
 
991 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  26.03 
 
 
577 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 
998 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.54 
 
 
998 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  25.07 
 
 
588 aa  74.3  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  26.11 
 
 
615 aa  71.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  25.72 
 
 
577 aa  71.6  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.86 
 
 
587 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  27.65 
 
 
592 aa  70.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.03 
 
 
563 aa  70.5  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  27.3 
 
 
577 aa  70.5  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  22.62 
 
 
578 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  24.59 
 
 
557 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.23 
 
 
562 aa  67.8  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.7 
 
 
655 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  30.77 
 
 
655 aa  67.4  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  26.72 
 
 
582 aa  67  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  25.93 
 
 
580 aa  65.1  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.59 
 
 
585 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  27.63 
 
 
640 aa  63.9  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.65 
 
 
580 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.6 
 
 
582 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.18 
 
 
582 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  24.18 
 
 
582 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  27.34 
 
 
610 aa  61.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.26 
 
 
592 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.26 
 
 
592 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  26.04 
 
 
601 aa  60.1  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  23.14 
 
 
600 aa  60.1  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  31.19 
 
 
546 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  20.34 
 
 
653 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  21.14 
 
 
585 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  21.14 
 
 
585 aa  57.4  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  25.39 
 
 
615 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  26.46 
 
 
599 aa  54.3  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  25.31 
 
 
570 aa  54.3  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.09 
 
 
612 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.09 
 
 
610 aa  51.2  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.09 
 
 
610 aa  51.2  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.09 
 
 
610 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  21.79 
 
 
610 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  24.48 
 
 
617 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  25.46 
 
 
621 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  23.43 
 
 
618 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.75 
 
 
656 aa  48.5  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>