129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2584 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  100 
 
 		 594 aa  1227    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  65.54 
 
 		 628 aa  811    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  34.15 
 
 		 610 aa  270  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  33.84 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  33.44 
 
 		 613 aa  258  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  30.86 
 
 		 580 aa  250  5e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  32.95 
 
 		 599 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  30.98 
 
 		 576 aa  229  8e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  31.83 
 
 		 586 aa  228  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  29.19 
 
 		 684 aa  226  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  32.58 
 
 		 584 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  33.6 
 
 		 519 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  31.76 
 
 		 555 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  27.27 
 
 		 606 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  26.42 
 
 		 595 aa  134  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  27.37 
 
 		 610 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  27.17 
 
 		 601 aa  127  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.2 
 
 		 578 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.2 
 
 		 578 aa  126  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  29.52 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  27.07 
 
 		 1153 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  25.58 
 
 		 596 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  26.42 
 
 		 594 aa  124  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  25.04 
 
 		 609 aa  124  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  27.71 
 
 		 593 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.19 
 
 		 1148 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  23.86 
 
 		 602 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  26 
 
 		 594 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.43 
 
 		 602 aa  122  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  24.18 
 
 		 602 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  27.58 
 
 		 608 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  23.97 
 
 		 602 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  26.63 
 
 		 645 aa  117  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  26.53 
 
 		 611 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  23.76 
 
 		 602 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  23.76 
 
 		 602 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  23.76 
 
 		 602 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  23.76 
 
 		 602 aa  115  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  25.28 
 
 		 591 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  26 
 
 		 601 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  23.37 
 
 		 810 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  24.01 
 
 		 584 aa  98.6  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  24.28 
 
 		 588 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  24.14 
 
 		 560 aa  90.5  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  26.5 
 
 		 570 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  23.52 
 
 		 925 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  27.68 
 
 		 581 aa  83.2  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  25 
 
 		 672 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  25.31 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  25.31 
 
 		 592 aa  81.6  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  25 
 
 		 574 aa  81.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  24.43 
 
 		 720 aa  77.8  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  24.87 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  24.63 
 
 		 615 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  25.5 
 
 		 574 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  24.7 
 
 		 818 aa  73.2  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  26.56 
 
 		 590 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  26.56 
 
 		 590 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.19 
 
 		 577 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  23.75 
 
 		 656 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  23.75 
 
 		 656 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.78 
 
 		 653 aa  70.9  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  25.15 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.13 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.14 
 
 		 577 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  24.61 
 
 		 655 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  24.35 
 
 		 655 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.57 
 
 		 580 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.33 
 
 		 585 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.27 
 
 		 580 aa  64.3  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.92 
 
 		 562 aa  62.4  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.99 
 
 		 578 aa  62.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  24.12 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  24.38 
 
 		 998 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  23.25 
 
 		 577 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  25.39 
 
 		 991 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  26.07 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  23.21 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  23.75 
 
 		 998 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  36.04 
 
 		 599 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.11 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.48 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  27.01 
 
 		 546 aa  60.1  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  25.36 
 
 		 582 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.48 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  24.48 
 
 		 582 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  22.67 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  26.4 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.47 
 
 		 592 aa  58.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  24.93 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.58 
 
 		 612 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  25.07 
 
 		 610 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  25.07 
 
 		 610 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  25.07 
 
 		 612 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  22.34 
 
 		 614 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.07 
 
 		 610 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  24.16 
 
 		 607 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  24.62 
 
 		 610 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  20.84 
 
 		 585 aa  54.3  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  20.84 
 
 		 585 aa  54.3  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>