128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5062 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  100 
 
 
588 aa  1150    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  46.74 
 
 
584 aa  501  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  33.68 
 
 
925 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  29.8 
 
 
560 aa  300  5e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  33.5 
 
 
574 aa  296  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  33.1 
 
 
574 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  33.22 
 
 
574 aa  290  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  35.8 
 
 
601 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  35.98 
 
 
645 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  33.68 
 
 
590 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  33.68 
 
 
590 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  30.15 
 
 
606 aa  277  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  33.97 
 
 
581 aa  277  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  35.7 
 
 
578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  33.05 
 
 
591 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  37.31 
 
 
594 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  37.4 
 
 
595 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  37.42 
 
 
594 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  36.33 
 
 
609 aa  238  2e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  35.47 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  30.86 
 
 
602 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  30.66 
 
 
602 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  30.66 
 
 
602 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  30.45 
 
 
602 aa  231  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  30.66 
 
 
602 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  28.09 
 
 
602 aa  231  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  28.09 
 
 
602 aa  231  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  28.09 
 
 
602 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  33.2 
 
 
593 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  34.51 
 
 
601 aa  213  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.96 
 
 
810 aa  209  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  28.12 
 
 
818 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  33.56 
 
 
610 aa  197  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  36.07 
 
 
570 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  29.17 
 
 
672 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  28.57 
 
 
613 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  30.48 
 
 
610 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  32.46 
 
 
608 aa  153  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 
578 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 
578 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  29.44 
 
 
586 aa  147  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  28.93 
 
 
584 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.2 
 
 
1148 aa  145  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  31.77 
 
 
599 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  27.48 
 
 
586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  30.77 
 
 
611 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  31.03 
 
 
1153 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  25.78 
 
 
576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  23.62 
 
 
580 aa  121  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  31.67 
 
 
555 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  30.92 
 
 
519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  24.36 
 
 
684 aa  102  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  31.44 
 
 
998 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  25 
 
 
594 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  32.14 
 
 
991 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  30.98 
 
 
998 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  28.74 
 
 
577 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  25.77 
 
 
618 aa  89  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  25.27 
 
 
619 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  30.86 
 
 
577 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  23.96 
 
 
628 aa  81.3  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  28.34 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.51 
 
 
592 aa  77.4  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.51 
 
 
592 aa  77.4  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  26.14 
 
 
582 aa  75.1  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  28.97 
 
 
577 aa  73.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.51 
 
 
580 aa  71.2  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  29.79 
 
 
655 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  25.64 
 
 
613 aa  68.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.25 
 
 
582 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.25 
 
 
582 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  27.25 
 
 
582 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.22 
 
 
580 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  28.44 
 
 
589 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  27.08 
 
 
615 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  21.88 
 
 
588 aa  65.1  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  25.34 
 
 
597 aa  65.1  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  27.76 
 
 
615 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  21.32 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  21.32 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  21.32 
 
 
612 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  26.33 
 
 
563 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.41 
 
 
557 aa  63.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  23.14 
 
 
572 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.32 
 
 
610 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  28.53 
 
 
655 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  19.91 
 
 
585 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  19.91 
 
 
585 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  21.05 
 
 
610 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  20.81 
 
 
612 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  21.81 
 
 
631 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  28.27 
 
 
601 aa  58.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  19.85 
 
 
612 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  24.79 
 
 
621 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  21.16 
 
 
601 aa  55.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  24.01 
 
 
842 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  21.54 
 
 
629 aa  56.2  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  23.58 
 
 
625 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  28.23 
 
 
600 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  24.81 
 
 
596 aa  54.7  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>