201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3172 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  100 
 
 
818 aa  1708    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  38.39 
 
 
810 aa  610  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  57.69 
 
 
447 aa  343  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  32.43 
 
 
606 aa  309  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  32.08 
 
 
601 aa  291  5.0000000000000004e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  31.87 
 
 
578 aa  284  4.0000000000000003e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  30.99 
 
 
645 aa  282  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  31.43 
 
 
591 aa  277  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  31.25 
 
 
602 aa  269  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  30.96 
 
 
602 aa  269  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  31.25 
 
 
602 aa  266  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  30.91 
 
 
602 aa  265  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  30.91 
 
 
602 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  30.91 
 
 
602 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  30.91 
 
 
602 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  31.08 
 
 
602 aa  262  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  32.95 
 
 
610 aa  237  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  27.05 
 
 
584 aa  226  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  30 
 
 
601 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  32.06 
 
 
593 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  30.33 
 
 
594 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  28.51 
 
 
595 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  29.57 
 
 
594 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  30.79 
 
 
609 aa  204  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  30.86 
 
 
596 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  28.09 
 
 
925 aa  197  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  24.15 
 
 
672 aa  189  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  28.12 
 
 
588 aa  187  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  28.12 
 
 
570 aa  182  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  25.22 
 
 
574 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  25.13 
 
 
574 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  25.48 
 
 
574 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  24.58 
 
 
613 aa  156  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  24.69 
 
 
610 aa  154  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  24.41 
 
 
611 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  25.22 
 
 
560 aa  147  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  24.49 
 
 
581 aa  147  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  24.71 
 
 
590 aa  146  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  24.71 
 
 
590 aa  146  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  25.46 
 
 
584 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.42 
 
 
578 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.42 
 
 
578 aa  139  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  22.65 
 
 
586 aa  130  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  24.26 
 
 
1148 aa  127  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.59 
 
 
586 aa  124  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  24.69 
 
 
684 aa  122  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  26.07 
 
 
555 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  23.67 
 
 
1153 aa  119  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  22.45 
 
 
599 aa  118  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  25.6 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  22.91 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  25.6 
 
 
576 aa  114  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  24.23 
 
 
608 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  31.21 
 
 
209 aa  95.1  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  31.4 
 
 
842 aa  90.9  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  30.05 
 
 
192 aa  87.8  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  32.16 
 
 
225 aa  86.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25.65 
 
 
655 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  34.36 
 
 
188 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  34.5 
 
 
189 aa  85.5  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  31.21 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  31.55 
 
 
192 aa  84  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  21.72 
 
 
813 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  31.74 
 
 
209 aa  82.8  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  26.77 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  25.23 
 
 
655 aa  80.9  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  30.95 
 
 
192 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  24.19 
 
 
628 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  28.85 
 
 
203 aa  79  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  31.9 
 
 
188 aa  77  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  28.02 
 
 
184 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.63 
 
 
582 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  24.63 
 
 
582 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  28.8 
 
 
303 aa  75.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  23.65 
 
 
582 aa  75.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.63 
 
 
582 aa  75.5  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  31.58 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  28.99 
 
 
187 aa  74.3  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  27.38 
 
 
191 aa  74.3  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  24.7 
 
 
594 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  30.64 
 
 
183 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  25.95 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  27.18 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  28.22 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  26.6 
 
 
344 aa  70.1  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  27.49 
 
 
207 aa  70.5  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  28.12 
 
 
221 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
194 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  28.04 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  24.53 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  27.61 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  21.86 
 
 
577 aa  67.8  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  26.18 
 
 
206 aa  67  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  27.55 
 
 
337 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  21.48 
 
 
998 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  24.87 
 
 
337 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  24.88 
 
 
366 aa  66.6  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  21.41 
 
 
618 aa  66.6  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  25.65 
 
 
205 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  23.31 
 
 
998 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>