72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1509 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  100 
 
 
221 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  87.67 
 
 
227 aa  390  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  86.16 
 
 
224 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  75 
 
 
206 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  58.64 
 
 
221 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  59.09 
 
 
221 aa  268  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  64.4 
 
 
236 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  63.87 
 
 
216 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  60 
 
 
229 aa  259  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  47.27 
 
 
819 aa  161  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  36.9 
 
 
189 aa  122  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  36.47 
 
 
192 aa  121  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  38.41 
 
 
842 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  34.34 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  36.47 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  38.79 
 
 
187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  35.48 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  33.53 
 
 
188 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  31.93 
 
 
188 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  34.68 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  32.94 
 
 
183 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  29.45 
 
 
810 aa  89.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  30.95 
 
 
203 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  32.74 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  29.27 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  31.55 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  29.44 
 
 
799 aa  75.5  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  30.37 
 
 
223 aa  75.1  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  29.52 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  27.44 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  28.12 
 
 
818 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  27.54 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  25.51 
 
 
447 aa  68.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  25.9 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  27.21 
 
 
303 aa  59.7  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  26.43 
 
 
315 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  25.71 
 
 
315 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  26.76 
 
 
315 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  26.19 
 
 
225 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  22.54 
 
 
813 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  24.46 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  24.47 
 
 
364 aa  52.4  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  25.56 
 
 
337 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  25.37 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  25.87 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  25.99 
 
 
354 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  24.39 
 
 
357 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  25 
 
 
400 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  23.48 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  23.31 
 
 
337 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  25.33 
 
 
338 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  25.33 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  25 
 
 
338 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  25.25 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  25.33 
 
 
338 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  25 
 
 
316 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  21.47 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  26.54 
 
 
339 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  21.66 
 
 
328 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  21.47 
 
 
244 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  21.47 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  26.36 
 
 
316 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  24.63 
 
 
337 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  26.36 
 
 
316 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  26.36 
 
 
316 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  27.93 
 
 
349 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  22.93 
 
 
443 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  24.44 
 
 
352 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>