114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0274 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  100 
 
 
303 aa  637    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  52.6 
 
 
315 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  53.65 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  51.56 
 
 
315 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  44.35 
 
 
337 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  41.35 
 
 
338 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  43.97 
 
 
337 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  40.32 
 
 
337 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  42.67 
 
 
336 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  40.93 
 
 
338 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  47.15 
 
 
316 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  40.93 
 
 
338 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  40.93 
 
 
338 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  45.41 
 
 
343 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  42.86 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  41.78 
 
 
338 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  41.78 
 
 
338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  42.86 
 
 
352 aa  199  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  46 
 
 
400 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  42.11 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  45.6 
 
 
316 aa  196  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  45.6 
 
 
316 aa  196  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  40.34 
 
 
337 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  45.6 
 
 
316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  40.62 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  41.06 
 
 
357 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  44.04 
 
 
205 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  38.49 
 
 
316 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  40.09 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  41.75 
 
 
344 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  42.65 
 
 
366 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  35.25 
 
 
349 aa  182  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  35.14 
 
 
380 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  41.88 
 
 
925 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  35.37 
 
 
274 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  38.65 
 
 
347 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  37.72 
 
 
354 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  43.78 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  40.31 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  37.61 
 
 
503 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  33.48 
 
 
443 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  34.59 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  34.59 
 
 
343 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 
443 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  33.51 
 
 
195 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  33.51 
 
 
344 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  32.97 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  30.84 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  31.44 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  34.59 
 
 
225 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  32.61 
 
 
338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  29.53 
 
 
209 aa  96.3  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  29.03 
 
 
813 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
194 aa  93.2  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  29.09 
 
 
222 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.88 
 
 
810 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  28.31 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  28.31 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  25.77 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  25.77 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  25.77 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  28.8 
 
 
818 aa  75.9  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  28.14 
 
 
199 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  25.79 
 
 
447 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  30.49 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  30.56 
 
 
842 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  27.21 
 
 
206 aa  67  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  27.11 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  27.33 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  27.03 
 
 
223 aa  63.5  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  27.27 
 
 
196 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  27.59 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  26.47 
 
 
203 aa  62  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  27.38 
 
 
191 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  28.89 
 
 
184 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  26.9 
 
 
221 aa  60.1  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  27.89 
 
 
224 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  27.21 
 
 
221 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  27.21 
 
 
227 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  26.21 
 
 
236 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  28.83 
 
 
207 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  23.53 
 
 
189 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  24.28 
 
 
496 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  30.7 
 
 
187 aa  57  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  26.9 
 
 
221 aa  56.6  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  25.13 
 
 
209 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  23.88 
 
 
209 aa  55.8  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  25.44 
 
 
188 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  24.83 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  26.32 
 
 
188 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  25.75 
 
 
161 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 
179 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0858714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2276  bifunctional AAC/APH  25.17 
 
 
179 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0137497 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  24 
 
 
359 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2753  acetyltransferase  23.33 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.228276  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  23.68 
 
 
799 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2964  acetyltransferase  23.33 
 
 
177 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2961  acetyltransferase, GNAT family  24 
 
 
177 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000203094 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>