80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3457 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  100 
 
 
207 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  64.25 
 
 
191 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  63.84 
 
 
184 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  51.11 
 
 
187 aa  181  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  47.34 
 
 
203 aa  178  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  50 
 
 
187 aa  177  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  44.12 
 
 
223 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  37.62 
 
 
842 aa  139  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  42.17 
 
 
196 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  39.53 
 
 
188 aa  122  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  41.77 
 
 
187 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  39.51 
 
 
188 aa  118  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  36.7 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  36.13 
 
 
209 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  38.33 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  34.76 
 
 
192 aa  106  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  34.76 
 
 
192 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  35.88 
 
 
183 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  32.51 
 
 
799 aa  98.2  7e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  38.25 
 
 
195 aa  95.5  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  30.82 
 
 
810 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  32.22 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  29.14 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  27.85 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  29.41 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  29.27 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  26.16 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  33.72 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  28.19 
 
 
236 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  28.39 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  28.83 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  29.24 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  34.39 
 
 
400 aa  72  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  27.49 
 
 
818 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  29.67 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  29.65 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  30.99 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  32 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  28.88 
 
 
316 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  27.33 
 
 
819 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  29.14 
 
 
925 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  31.32 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  28.57 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  34.23 
 
 
337 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  32.59 
 
 
337 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  29.27 
 
 
347 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  31.82 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  29.81 
 
 
316 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  31.51 
 
 
357 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  31.53 
 
 
316 aa  62  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  31.53 
 
 
316 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  30.37 
 
 
366 aa  62  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  31.53 
 
 
316 aa  62  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  30.06 
 
 
338 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  30.06 
 
 
338 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  29.9 
 
 
338 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  30.06 
 
 
338 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  27.88 
 
 
315 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  29.65 
 
 
503 aa  60.1  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  30.06 
 
 
336 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  28 
 
 
349 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  32.61 
 
 
364 aa  59.7  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  31.51 
 
 
328 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  30.5 
 
 
341 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  28.31 
 
 
315 aa  58.5  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  28.83 
 
 
303 aa  58.2  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  29.38 
 
 
338 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  30.81 
 
 
366 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  29.38 
 
 
338 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  26.24 
 
 
813 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  27.11 
 
 
343 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  29.07 
 
 
380 aa  55.1  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  28.23 
 
 
315 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  27.18 
 
 
274 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  25.29 
 
 
339 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  26.9 
 
 
443 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  26.95 
 
 
222 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>