85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3461 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  63.74 
 
 
188 aa  239  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  63.74 
 
 
188 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  66.67 
 
 
183 aa  237  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  59.32 
 
 
209 aa  214  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  55.42 
 
 
187 aa  177  9e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  50.86 
 
 
196 aa  162  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  46.51 
 
 
842 aa  161  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  47.98 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  43.1 
 
 
192 aa  144  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  42.53 
 
 
192 aa  141  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  35.96 
 
 
224 aa  124  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  36.9 
 
 
221 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  35.96 
 
 
227 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  39.68 
 
 
799 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  33.71 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  42.77 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  42.2 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  37.5 
 
 
221 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  35.96 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  35 
 
 
221 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  38.33 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  36.14 
 
 
229 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  33.33 
 
 
819 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  36.81 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  37.42 
 
 
216 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  35.39 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  36.47 
 
 
810 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  35.75 
 
 
223 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  33.15 
 
 
203 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  33.51 
 
 
447 aa  91.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  32.95 
 
 
225 aa  88.6  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  30.22 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  34.5 
 
 
818 aa  85.5  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  26.95 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  29.41 
 
 
209 aa  72  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  29.94 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  29.94 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  29.94 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  29.94 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  29.94 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  27.91 
 
 
337 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  29.38 
 
 
352 aa  68.2  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  29.94 
 
 
338 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  29.94 
 
 
338 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  30.41 
 
 
354 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  26.63 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  25.44 
 
 
400 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  27.54 
 
 
357 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  28.07 
 
 
337 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  25.6 
 
 
366 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  24.59 
 
 
813 aa  63.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  29.65 
 
 
443 aa  63.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  27.97 
 
 
244 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  27.97 
 
 
244 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  27.97 
 
 
224 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  27.13 
 
 
205 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  24.86 
 
 
344 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  26.44 
 
 
316 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  27.52 
 
 
222 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  25.56 
 
 
328 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  25.14 
 
 
925 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  28.42 
 
 
364 aa  59.3  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  27.01 
 
 
343 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  25 
 
 
337 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  29.08 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  27.32 
 
 
366 aa  58.2  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  23.53 
 
 
303 aa  57.8  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  27.75 
 
 
274 aa  57  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  28.31 
 
 
349 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  28.26 
 
 
357 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  24.44 
 
 
315 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  23.91 
 
 
316 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  22.78 
 
 
315 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  24.4 
 
 
341 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  27.72 
 
 
347 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  22.78 
 
 
315 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  23.76 
 
 
316 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  23.66 
 
 
316 aa  50.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  23.66 
 
 
316 aa  50.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  27.89 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  24.65 
 
 
199 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  23.27 
 
 
380 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  24.34 
 
 
443 aa  41.6  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>