98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3739 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  703    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  66.27 
 
 		 366 aa  429  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  53.87 
 
 		 364 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  62.5 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  53.96 
 
 		 366 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  48.81 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  53.96 
 
 		 380 aa  292  6e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  51.62 
 
 		 352 aa  287  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  57.08 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  48.25 
 
 		 349 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  46.85 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  46.84 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  47.47 
 
 		 337 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  46.64 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  43.3 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  44.64 
 
 		 338 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  48.16 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  48.93 
 
 		 338 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  44.64 
 
 		 339 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  48.47 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  50.88 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  48.47 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  48.47 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  47.21 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  39.82 
 
 		 336 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  42.68 
 
 		 354 aa  226  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  53.81 
 
 		 205 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  45.34 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  43.27 
 
 		 357 aa  192  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  43.56 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  42.22 
 
 		 315 aa  186  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  41.78 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  41.75 
 
 		 303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  41.59 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  41.59 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  39.33 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  41.15 
 
 		 316 aa  180  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  40.95 
 
 		 925 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  38.7 
 
 		 274 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  45.13 
 
 		 443 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  39.44 
 
 		 443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  32.9 
 
 		 503 aa  152  8.999999999999999e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  37.4 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  36.59 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  36.59 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  36.99 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  35.77 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  35.37 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  35.55 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  33.52 
 
 		 192 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  32.26 
 
 		 195 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 		 194 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  30.94 
 
 		 225 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  29.03 
 
 		 209 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  26.9 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.2 
 
 		 810 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  27.59 
 
 		 813 aa  79.3  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  31.67 
 
 		 842 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  26.9 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  26.9 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  26.9 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  31.02 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  26.97 
 
 		 205 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  29.35 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  26.84 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  25.73 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  26.6 
 
 		 818 aa  70.1  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  29.65 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  24.26 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  28.73 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  26.32 
 
 		 191 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  27.81 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  24.86 
 
 		 189 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  26.67 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  27.75 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  27.22 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  28.07 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  26.37 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  30 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2961  acetyltransferase, GNAT family  24.31 
 
 		 177 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000203094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2964  acetyltransferase  24.31 
 
 		 177 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2681  acetyltransferase  24.31 
 
 		 177 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2753  acetyltransferase  24.31 
 
 		 177 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.228276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2702  acetyltransferase  24.31 
 
 		 177 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  25.27 
 
 		 183 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  20 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  24.14 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0128  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 		 159 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  26.25 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  22.92 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  23.23 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0858714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2276  bifunctional AAC/APH  22.76 
 
 		 179 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0137497 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2964  acetyltransferase, GNAT family  23.45 
 
 		 178 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  23.33 
 
 		 203 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  32.29 
 
 		 799 aa  46.6  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  22.99 
 
 		 223 aa  46.2  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  24.85 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  22.08 
 
 		 819 aa  42.7  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>