218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0591 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  100 
 
 
810 aa  1699    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  38.39 
 
 
818 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  33.06 
 
 
645 aa  327  7e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  31.46 
 
 
578 aa  316  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  32.91 
 
 
601 aa  311  4e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  33.89 
 
 
602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  34 
 
 
602 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  32.09 
 
 
591 aa  306  7e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  33.39 
 
 
602 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  34 
 
 
602 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  33.39 
 
 
602 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  33.39 
 
 
602 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  32.01 
 
 
606 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  31.99 
 
 
602 aa  303  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  32.83 
 
 
602 aa  299  1e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  33.33 
 
 
610 aa  253  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  32.37 
 
 
594 aa  248  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  32.16 
 
 
594 aa  248  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  31.91 
 
 
601 aa  245  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  32.75 
 
 
593 aa  239  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  29.36 
 
 
609 aa  238  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  28.48 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  39.08 
 
 
447 aa  234  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  30.64 
 
 
595 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  26.23 
 
 
925 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  31.36 
 
 
570 aa  213  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  25.04 
 
 
672 aa  208  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  26.48 
 
 
584 aa  203  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  26.96 
 
 
588 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  27.23 
 
 
574 aa  191  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.94 
 
 
613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  29.3 
 
 
581 aa  185  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  28.31 
 
 
574 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  27.94 
 
 
574 aa  179  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  29.24 
 
 
590 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  29.24 
 
 
590 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  26.93 
 
 
610 aa  177  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.37 
 
 
1148 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  26.17 
 
 
560 aa  169  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  26.54 
 
 
611 aa  154  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  26.77 
 
 
1153 aa  146  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  26.32 
 
 
584 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  24.63 
 
 
578 aa  142  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  24.63 
 
 
578 aa  142  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.32 
 
 
586 aa  139  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  24.46 
 
 
586 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  23.6 
 
 
608 aa  135  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  25.75 
 
 
576 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  24.52 
 
 
599 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  33.72 
 
 
842 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  26.09 
 
 
580 aa  118  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  25.95 
 
 
519 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  24.43 
 
 
684 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  26.88 
 
 
555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  34.94 
 
 
192 aa  112  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  25.71 
 
 
628 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  34.78 
 
 
192 aa  110  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  36.47 
 
 
189 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  30.39 
 
 
192 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  30.99 
 
 
209 aa  105  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  23.37 
 
 
594 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  30.39 
 
 
225 aa  100  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  33.93 
 
 
188 aa  99.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  31.45 
 
 
216 aa  99  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  31.55 
 
 
187 aa  98.2  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  31.45 
 
 
221 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  31.45 
 
 
229 aa  97.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  26.94 
 
 
354 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  30.82 
 
 
221 aa  96.7  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  32.93 
 
 
196 aa  96.7  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  29.17 
 
 
224 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  29.21 
 
 
195 aa  94.4  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  28.49 
 
 
236 aa  94.4  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  30.95 
 
 
209 aa  91.3  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  32.14 
 
 
188 aa  91.7  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  27.6 
 
 
227 aa  91.3  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  30.82 
 
 
207 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  29.45 
 
 
221 aa  90.1  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  28.18 
 
 
203 aa  88.2  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  27.41 
 
 
339 aa  87.8  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  26.49 
 
 
357 aa  87.8  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  24.2 
 
 
653 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.58 
 
 
577 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  25.28 
 
 
206 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.12 
 
 
578 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  28.42 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  26.88 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  29.27 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  25.45 
 
 
655 aa  84  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  32.07 
 
 
183 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  24.55 
 
 
336 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  23.96 
 
 
655 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  24.23 
 
 
998 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  26.46 
 
 
338 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  28.05 
 
 
184 aa  81.6  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  26.2 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  24.82 
 
 
582 aa  81.3  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  23.33 
 
 
998 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  25.93 
 
 
338 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>