113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4392 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  78.6 
 
 		 609 aa  915    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  100 
 
 		 596 aa  1203    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  74.05 
 
 		 593 aa  875    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  52.24 
 
 		 595 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  51.36 
 
 		 594 aa  551  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  50.67 
 
 		 594 aa  546  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  42.17 
 
 		 610 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  35.61 
 
 		 602 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  35.53 
 
 		 602 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  35.44 
 
 		 602 aa  343  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  35.27 
 
 		 602 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  35.27 
 
 		 602 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  35.6 
 
 		 602 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  35.6 
 
 		 602 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  34.94 
 
 		 602 aa  332  9e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  35.76 
 
 		 591 aa  311  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  36.91 
 
 		 601 aa  300  5e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  40.7 
 
 		 645 aa  293  7e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  36.29 
 
 		 578 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  30.96 
 
 		 606 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  37.08 
 
 		 584 aa  251  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  34.6 
 
 		 601 aa  237  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  28.48 
 
 		 810 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  35.47 
 
 		 588 aa  226  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  31.35 
 
 		 925 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  31.22 
 
 		 672 aa  209  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  36.73 
 
 		 570 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  30.86 
 
 		 818 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  30.17 
 
 		 610 aa  184  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  28.2 
 
 		 613 aa  181  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  31.04 
 
 		 574 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  27.65 
 
 		 586 aa  170  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  30.02 
 
 		 574 aa  166  8e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  30.53 
 
 		 574 aa  166  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  29.51 
 
 		 584 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  26.49 
 
 		 578 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  26.49 
 
 		 578 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  26.72 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  33.57 
 
 		 608 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  26.75 
 
 		 580 aa  156  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  30.4 
 
 		 611 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  33.83 
 
 		 555 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  29.78 
 
 		 1148 aa  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  31.03 
 
 		 590 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  31.14 
 
 		 581 aa  148  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  31.03 
 
 		 590 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  28.25 
 
 		 586 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  29.19 
 
 		 576 aa  145  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  25.8 
 
 		 684 aa  141  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  28.24 
 
 		 1153 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  25.7 
 
 		 594 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  31.49 
 
 		 519 aa  127  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  25.9 
 
 		 628 aa  124  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  30.23 
 
 		 599 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.51 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  24.68 
 
 		 720 aa  78.2  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  26.13 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.77 
 
 		 563 aa  76.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  27.54 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.74 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.16 
 
 		 585 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.86 
 
 		 580 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.42 
 
 		 557 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  28 
 
 		 615 aa  68.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  27.74 
 
 		 600 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  27.54 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  25.23 
 
 		 580 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.87 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.87 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  26.87 
 
 		 582 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  27.78 
 
 		 655 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.12 
 
 		 592 aa  64.3  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.12 
 
 		 592 aa  64.3  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  25.84 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  25.08 
 
 		 610 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  27.16 
 
 		 640 aa  62  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  26.71 
 
 		 655 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  27.99 
 
 		 546 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  25.83 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  26.06 
 
 		 991 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  20.95 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  20.95 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  20.95 
 
 		 612 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  20.95 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  21.2 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  24.89 
 
 		 998 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.68 
 
 		 562 aa  57.4  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  20.59 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  20.59 
 
 		 585 aa  56.6  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  26.85 
 
 		 599 aa  56.2  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.85 
 
 		 578 aa  54.3  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  24.55 
 
 		 577 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  26.61 
 
 		 998 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  25.49 
 
 		 601 aa  52.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  25.8 
 
 		 594 aa  52.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  22.59 
 
 		 618 aa  50.8  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  22.99 
 
 		 619 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  21.28 
 
 		 656 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  21.28 
 
 		 656 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  24.32 
 
 		 621 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>