149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1113 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  100 
 
 		 608 aa  1233    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  54.72 
 
 		 611 aa  588  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  39.52 
 
 		 1148 aa  333  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  32.54 
 
 		 578 aa  257  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  32.54 
 
 		 578 aa  257  4e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  40 
 
 		 1153 aa  239  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  30.23 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  29.67 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  33.26 
 
 		 578 aa  183  7e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  29.91 
 
 		 584 aa  173  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  35.23 
 
 		 609 aa  170  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  33.18 
 
 		 599 aa  167  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  28.43 
 
 		 606 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  33.78 
 
 		 610 aa  167  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  32.01 
 
 		 570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  29.6 
 
 		 602 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  33.26 
 
 		 593 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  25.46 
 
 		 602 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  25.46 
 
 		 602 aa  163  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.25 
 
 		 602 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  27.92 
 
 		 580 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  29.5 
 
 		 602 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  25.25 
 
 		 602 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  28.31 
 
 		 602 aa  158  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  33.57 
 
 		 596 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  30.99 
 
 		 601 aa  157  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  32.51 
 
 		 519 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  29.96 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  29.96 
 
 		 590 aa  154  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  29.68 
 
 		 581 aa  154  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  29.08 
 
 		 591 aa  152  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  28.12 
 
 		 602 aa  152  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  29.25 
 
 		 645 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  27.55 
 
 		 584 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  32.64 
 
 		 595 aa  146  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  32.4 
 
 		 594 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  27.31 
 
 		 574 aa  146  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  28.67 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  32.61 
 
 		 588 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  30.63 
 
 		 594 aa  144  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  27.95 
 
 		 574 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  29.49 
 
 		 576 aa  141  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  30.65 
 
 		 601 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  27.19 
 
 		 574 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.62 
 
 		 560 aa  138  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  23.6 
 
 		 810 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  23.64 
 
 		 684 aa  130  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  25.45 
 
 		 925 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  27.58 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  30.5 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  25.42 
 
 		 628 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  24.23 
 
 		 818 aa  110  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  29.08 
 
 		 577 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  24.2 
 
 		 588 aa  94  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  28.44 
 
 		 562 aa  92.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  28.95 
 
 		 998 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  30.06 
 
 		 991 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  29.81 
 
 		 998 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  25.88 
 
 		 585 aa  88.2  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  25.88 
 
 		 585 aa  88.2  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  30.87 
 
 		 672 aa  87  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.59 
 
 		 577 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  31.18 
 
 		 557 aa  85.1  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  28.38 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  25.81 
 
 		 577 aa  83.6  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.08 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  27.14 
 
 		 615 aa  80.1  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  27.08 
 
 		 580 aa  79.7  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  23.65 
 
 		 585 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.86 
 
 		 653 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  25.07 
 
 		 618 aa  77.8  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  21.93 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  21.93 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  25.52 
 
 		 619 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  30.85 
 
 		 600 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  29.12 
 
 		 655 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.25 
 
 		 580 aa  73.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  27.8 
 
 		 589 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  26.52 
 
 		 582 aa  72  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  27.1 
 
 		 720 aa  70.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.04 
 
 		 655 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  24.25 
 
 		 580 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  27.03 
 
 		 599 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.05 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.05 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  26.05 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  25.57 
 
 		 617 aa  67.4  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  28.44 
 
 		 587 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  25.38 
 
 		 625 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  22.69 
 
 		 629 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  21.99 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  21.28 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  21.51 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  21.51 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.51 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  21.51 
 
 		 612 aa  64.3  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  21.98 
 
 		 819 aa  64.3  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  22.16 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  26.84 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>