138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1811 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  100 
 
 
599 aa  1217    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  47.26 
 
 
813 aa  561  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  50.26 
 
 
601 aa  554  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  46.64 
 
 
621 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  42.74 
 
 
614 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  43.65 
 
 
616 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  40.68 
 
 
716 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  37.48 
 
 
639 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  36.61 
 
 
615 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  37.54 
 
 
621 aa  360  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  39.03 
 
 
615 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  35.69 
 
 
614 aa  339  8e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  35.51 
 
 
614 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  36.35 
 
 
597 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  33.56 
 
 
607 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  32.92 
 
 
601 aa  320  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  36.1 
 
 
594 aa  319  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  33.96 
 
 
642 aa  319  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  33.05 
 
 
642 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  33.28 
 
 
629 aa  317  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  33.28 
 
 
631 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  36.26 
 
 
613 aa  316  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  33.05 
 
 
642 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  32.88 
 
 
642 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  32.88 
 
 
642 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  33.28 
 
 
631 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  30.76 
 
 
819 aa  313  7.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  34.53 
 
 
635 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  36.69 
 
 
596 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  34.46 
 
 
582 aa  303  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  36.81 
 
 
842 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  32.65 
 
 
572 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  34.62 
 
 
580 aa  301  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  30.41 
 
 
608 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  34.81 
 
 
580 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  35.05 
 
 
625 aa  296  9e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  35.29 
 
 
596 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  33.28 
 
 
604 aa  290  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  33.75 
 
 
577 aa  289  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  32.94 
 
 
604 aa  283  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  32.32 
 
 
582 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  32.32 
 
 
582 aa  279  9e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  32.32 
 
 
582 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  28.6 
 
 
578 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  35.73 
 
 
602 aa  273  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  33.33 
 
 
799 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.26 
 
 
612 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.38 
 
 
612 aa  223  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.69 
 
 
610 aa  220  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  26.69 
 
 
610 aa  220  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  26.69 
 
 
612 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  26.52 
 
 
610 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  26.52 
 
 
610 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  29.72 
 
 
619 aa  217  4e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  30.59 
 
 
592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  30.59 
 
 
592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  30.7 
 
 
1148 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  25.84 
 
 
613 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  30.72 
 
 
618 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  33.56 
 
 
617 aa  207  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  31.74 
 
 
589 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  31.94 
 
 
1153 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  29.2 
 
 
562 aa  169  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.8 
 
 
577 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  26.99 
 
 
615 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  28.5 
 
 
577 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  29.6 
 
 
991 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  29.22 
 
 
998 aa  146  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  29.55 
 
 
998 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  25.68 
 
 
655 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  25.15 
 
 
720 aa  86.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  20.92 
 
 
580 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25.67 
 
 
655 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  24.84 
 
 
633 aa  84  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  25.54 
 
 
610 aa  82.8  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  20.41 
 
 
580 aa  80.9  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  25.74 
 
 
610 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  21.48 
 
 
588 aa  75.5  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  24.7 
 
 
656 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  24.7 
 
 
656 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  27.03 
 
 
608 aa  68.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  25.61 
 
 
586 aa  68.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  19.32 
 
 
575 aa  67  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  23.31 
 
 
613 aa  64.7  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  21.28 
 
 
580 aa  64.3  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  19.04 
 
 
575 aa  64.3  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  26.32 
 
 
611 aa  62  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  21.47 
 
 
637 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  22.55 
 
 
576 aa  61.2  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  26.3 
 
 
574 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  23.94 
 
 
585 aa  60.1  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  36.04 
 
 
594 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  25.65 
 
 
563 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  25.07 
 
 
574 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  26.77 
 
 
574 aa  59.3  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  25.66 
 
 
645 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  25.58 
 
 
637 aa  58.9  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  25.26 
 
 
601 aa  57.4  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>