129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3032 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 601 aa  1256    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  90.02 
 
 		 629 aa  1139    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  89.68 
 
 		 631 aa  1139    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  90.18 
 
 		 631 aa  1139    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  81.82 
 
 		 642 aa  1045    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  83.45 
 
 		 642 aa  1044    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  82.26 
 
 		 642 aa  1047    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  56.51 
 
 		 604 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  82.15 
 
 		 642 aa  1045    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  56.35 
 
 		 604 aa  676    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  59.63 
 
 		 819 aa  744    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  81.98 
 
 		 642 aa  1043    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  51.52 
 
 		 842 aa  629  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  51.35 
 
 		 614 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  51.18 
 
 		 614 aa  605  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  48.09 
 
 		 635 aa  599  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  49.23 
 
 		 596 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  49.33 
 
 		 625 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  48.72 
 
 		 594 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  48.72 
 
 		 596 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  48.47 
 
 		 608 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  47.38 
 
 		 597 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  48.57 
 
 		 613 aa  569  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  45.78 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  42.37 
 
 		 602 aa  485  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  43.22 
 
 		 799 aa  477  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  37.57 
 
 		 639 aa  412  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  37.84 
 
 		 615 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  36.52 
 
 		 601 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  33.98 
 
 		 614 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  34.49 
 
 		 813 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  32.66 
 
 		 599 aa  309  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  32.11 
 
 		 621 aa  306  6e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  28.9 
 
 		 580 aa  272  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  31.68 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  28.29 
 
 		 577 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.55 
 
 		 580 aa  267  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  29.08 
 
 		 582 aa  262  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.28 
 
 		 582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  29.98 
 
 		 621 aa  254  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.28 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  28.28 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  28.62 
 
 		 615 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  28.49 
 
 		 572 aa  242  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  30.29 
 
 		 619 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  27.57 
 
 		 578 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  27.37 
 
 		 716 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  25.89 
 
 		 610 aa  213  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  26.03 
 
 		 610 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  26.03 
 
 		 612 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.03 
 
 		 610 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  27.38 
 
 		 610 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  28.35 
 
 		 618 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.43 
 
 		 612 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.17 
 
 		 612 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  28.45 
 
 		 617 aa  195  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  27.7 
 
 		 589 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  28.42 
 
 		 1153 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  28.06 
 
 		 1148 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  24.58 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  25.23 
 
 		 592 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  25.23 
 
 		 592 aa  167  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.71 
 
 		 998 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  26.51 
 
 		 998 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.6 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 		 991 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.06 
 
 		 577 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  23.68 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.44 
 
 		 615 aa  137  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  22.64 
 
 		 580 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  26.02 
 
 		 633 aa  104  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  22.86 
 
 		 580 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  25 
 
 		 575 aa  91.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  22.94 
 
 		 655 aa  91.3  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  20.13 
 
 		 588 aa  90.9  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  22.94 
 
 		 655 aa  90.1  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  23.47 
 
 		 720 aa  88.6  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  24.4 
 
 		 575 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  25.06 
 
 		 610 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  23.36 
 
 		 613 aa  84.7  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  21.61 
 
 		 610 aa  84.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  23.01 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  23 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  19.72 
 
 		 925 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  21.28 
 
 		 608 aa  64.7  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  24.6 
 
 		 584 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  24.6 
 
 		 584 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  22.81 
 
 		 584 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  19.25 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  21.73 
 
 		 601 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  19.83 
 
 		 580 aa  60.5  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  20.35 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  20.35 
 
 		 656 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  24.06 
 
 		 574 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  23.62 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  23.62 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  24.41 
 
 		 589 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  21.13 
 
 		 810 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  23.31 
 
 		 574 aa  56.6  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  20.12 
 
 		 585 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>