110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4058 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  100 
 
 		 716 aa  1404    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  57.98 
 
 		 616 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  40.99 
 
 		 599 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  36.5 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  34.74 
 
 		 621 aa  382  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  32.55 
 
 		 813 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  33.09 
 
 		 614 aa  330  6e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  28.44 
 
 		 639 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  28.42 
 
 		 615 aa  287  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  34.66 
 
 		 596 aa  285  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  35.35 
 
 		 615 aa  282  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  34.32 
 
 		 596 aa  281  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  32.24 
 
 		 621 aa  281  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  33.63 
 
 		 594 aa  270  8e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  30.04 
 
 		 582 aa  269  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  33.22 
 
 		 580 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  32.57 
 
 		 613 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  31.27 
 
 		 597 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  33.39 
 
 		 580 aa  254  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  27.7 
 
 		 642 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.49 
 
 		 582 aa  253  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  27.55 
 
 		 642 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  27.7 
 
 		 642 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  27.85 
 
 		 642 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.34 
 
 		 582 aa  250  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  29.34 
 
 		 582 aa  250  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  27.66 
 
 		 601 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  32.51 
 
 		 577 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  31.21 
 
 		 842 aa  249  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  31.59 
 
 		 635 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  27.41 
 
 		 642 aa  249  2e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  28.61 
 
 		 614 aa  244  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  27.77 
 
 		 631 aa  243  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  30.02 
 
 		 607 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  28.47 
 
 		 614 aa  241  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  27.77 
 
 		 629 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  28.01 
 
 		 604 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  28.94 
 
 		 572 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  25.53 
 
 		 819 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  28.16 
 
 		 608 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  30.53 
 
 		 625 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  33.09 
 
 		 602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  27.87 
 
 		 604 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  27.18 
 
 		 631 aa  233  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.4 
 
 		 578 aa  201  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  27.91 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  28 
 
 		 612 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  26.66 
 
 		 610 aa  191  5e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.66 
 
 		 610 aa  191  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  26.48 
 
 		 610 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  26.66 
 
 		 612 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.51 
 
 		 612 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  28.38 
 
 		 610 aa  188  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  30.66 
 
 		 799 aa  187  8e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  30.06 
 
 		 617 aa  168  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  28.05 
 
 		 618 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  27.41 
 
 		 619 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  29.87 
 
 		 589 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.66 
 
 		 592 aa  149  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.66 
 
 		 592 aa  149  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  30.98 
 
 		 1153 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.97 
 
 		 1148 aa  147  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  28.83 
 
 		 562 aa  126  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  29.06 
 
 		 998 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  29.92 
 
 		 577 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  29.76 
 
 		 577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  28.42 
 
 		 998 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.4 
 
 		 615 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  30.52 
 
 		 991 aa  114  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  28.02 
 
 		 610 aa  88.2  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.96 
 
 		 655 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  29.15 
 
 		 655 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  22.73 
 
 		 580 aa  75.1  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  26.97 
 
 		 720 aa  73.9  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  28.3 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.78 
 
 		 580 aa  71.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.1 
 
 		 563 aa  70.5  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  27.84 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  28.78 
 
 		 586 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  22.83 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  25.68 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  21.91 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  21.91 
 
 		 656 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  27.27 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  24.9 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  26.06 
 
 		 555 aa  57.4  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  22.78 
 
 		 575 aa  56.2  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.6 
 
 		 613 aa  55.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  27.8 
 
 		 586 aa  55.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  31.34 
 
 		 672 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  23.98 
 
 		 581 aa  54.3  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 		 570 aa  53.9  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  27.69 
 
 		 596 aa  53.9  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  29.28 
 
 		 609 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  22.39 
 
 		 575 aa  52  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  28.11 
 
 		 645 aa  51.6  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  26.61 
 
 		 637 aa  51.6  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  26.45 
 
 		 574 aa  50.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  24.34 
 
 		 925 aa  50.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  30.54 
 
 		 587 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>