148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0635 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  100 
 
 
610 aa  1231    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  54.37 
 
 
637 aa  625  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  49.83 
 
 
633 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  36.26 
 
 
655 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  36.45 
 
 
655 aa  299  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  25.67 
 
 
588 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  27.42 
 
 
580 aa  167  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  27.02 
 
 
580 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  28.63 
 
 
720 aa  151  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  25.77 
 
 
575 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  25.38 
 
 
575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  25 
 
 
592 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  25 
 
 
592 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  25.71 
 
 
585 aa  118  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  22.88 
 
 
610 aa  117  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  27.23 
 
 
601 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.75 
 
 
610 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.75 
 
 
610 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.75 
 
 
610 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.75 
 
 
612 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  25.78 
 
 
563 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  26.27 
 
 
585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  26.27 
 
 
585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  24.33 
 
 
613 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  23.46 
 
 
653 aa  110  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  23.37 
 
 
656 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  23.37 
 
 
656 aa  107  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  26.09 
 
 
615 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.82 
 
 
612 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.08 
 
 
612 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  27.96 
 
 
1153 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  30.19 
 
 
615 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  31.04 
 
 
640 aa  100  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  26.76 
 
 
589 aa  99.4  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  26.27 
 
 
621 aa  98.6  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  27.48 
 
 
582 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  23.74 
 
 
618 aa  98.2  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  23.24 
 
 
619 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.39 
 
 
998 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  29.72 
 
 
621 aa  96.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.3 
 
 
582 aa  95.5  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.3 
 
 
582 aa  95.1  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  27.3 
 
 
582 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.49 
 
 
991 aa  94  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  26.72 
 
 
998 aa  94  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  27.05 
 
 
577 aa  93.6  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  22.34 
 
 
615 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  22.43 
 
 
813 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  25.98 
 
 
602 aa  89  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  22.48 
 
 
631 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  22.78 
 
 
631 aa  87.8  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  22.78 
 
 
629 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.44 
 
 
580 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  22.84 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.05 
 
 
577 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  21.61 
 
 
601 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  25.69 
 
 
577 aa  84  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  26.38 
 
 
562 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  25.62 
 
 
617 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  25.54 
 
 
599 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.41 
 
 
580 aa  80.5  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.46 
 
 
613 aa  80.1  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  27.84 
 
 
599 aa  80.1  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  27.73 
 
 
716 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  28.01 
 
 
600 aa  78.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  25 
 
 
625 aa  77.8  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  22.56 
 
 
639 aa  76.3  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  22.55 
 
 
642 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  26.32 
 
 
592 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  25.64 
 
 
799 aa  75.1  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  24.83 
 
 
627 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  25 
 
 
578 aa  75.5  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  25.66 
 
 
557 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  24.73 
 
 
546 aa  75.5  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  22.06 
 
 
642 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  22.12 
 
 
642 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  22.3 
 
 
642 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  22.56 
 
 
642 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  32.05 
 
 
616 aa  74.3  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  29.91 
 
 
587 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  26.63 
 
 
645 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  24.15 
 
 
604 aa  72.8  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  20.64 
 
 
819 aa  72.8  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  24.83 
 
 
637 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  25.32 
 
 
610 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  24.19 
 
 
586 aa  69.7  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  25.7 
 
 
578 aa  67  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  20.92 
 
 
584 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  20.92 
 
 
584 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  23.78 
 
 
1148 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  23.53 
 
 
604 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  23.81 
 
 
591 aa  64.3  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  23.22 
 
 
613 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.07 
 
 
587 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  22.98 
 
 
614 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  25.42 
 
 
611 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  24.38 
 
 
842 aa  62.4  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  24.38 
 
 
570 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  24.16 
 
 
597 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  22.98 
 
 
614 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>