140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1812 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  100 
 
 
578 aa  1185    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  36.6 
 
 
572 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  35.12 
 
 
621 aa  372  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  33.51 
 
 
615 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  32.99 
 
 
577 aa  352  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  32.76 
 
 
580 aa  340  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  32.81 
 
 
582 aa  339  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  32.58 
 
 
582 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  32.58 
 
 
582 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  32.07 
 
 
580 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  32.41 
 
 
582 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  30.86 
 
 
615 aa  290  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  31.69 
 
 
813 aa  289  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  31.36 
 
 
601 aa  281  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  30.55 
 
 
639 aa  276  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  27.99 
 
 
621 aa  267  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  28.6 
 
 
599 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  26.26 
 
 
614 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.09 
 
 
614 aa  243  7.999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  27.23 
 
 
631 aa  240  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  27.15 
 
 
613 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  27.23 
 
 
629 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  27.57 
 
 
601 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  26.85 
 
 
819 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  26.93 
 
 
597 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  25.98 
 
 
614 aa  233  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  27.43 
 
 
594 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  26.71 
 
 
631 aa  231  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  27.62 
 
 
642 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  29.18 
 
 
607 aa  230  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  26.02 
 
 
842 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  26.4 
 
 
642 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  27.32 
 
 
642 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  27.1 
 
 
642 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  27.32 
 
 
642 aa  226  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  27.58 
 
 
608 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  27.13 
 
 
616 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  24.96 
 
 
596 aa  216  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  24.46 
 
 
635 aa  216  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  24.62 
 
 
596 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.4 
 
 
604 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  26.19 
 
 
625 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  26.23 
 
 
604 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  24.55 
 
 
602 aa  199  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  26.24 
 
 
610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  23.93 
 
 
799 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  26.24 
 
 
610 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  26.24 
 
 
610 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  26.24 
 
 
612 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.24 
 
 
610 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  23.14 
 
 
716 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.25 
 
 
612 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.64 
 
 
612 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  25.21 
 
 
619 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.74 
 
 
618 aa  161  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  24.62 
 
 
1148 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.26 
 
 
615 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  24.24 
 
 
613 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  24.88 
 
 
991 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.71 
 
 
577 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  23.11 
 
 
589 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  22.15 
 
 
1153 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  23.58 
 
 
998 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  23.72 
 
 
998 aa  134  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  23.3 
 
 
617 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.05 
 
 
592 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.05 
 
 
592 aa  131  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  27.14 
 
 
562 aa  130  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26.88 
 
 
577 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  24.62 
 
 
633 aa  118  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  25.06 
 
 
580 aa  100  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  25.67 
 
 
580 aa  99.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  23.79 
 
 
655 aa  93.2  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  22.99 
 
 
637 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  23.87 
 
 
655 aa  87.4  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  23.12 
 
 
810 aa  85.1  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  22.45 
 
 
585 aa  83.6  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  20.87 
 
 
610 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  22.12 
 
 
588 aa  77.8  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  21.41 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  25 
 
 
610 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  24.46 
 
 
578 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  24.46 
 
 
578 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  22.61 
 
 
925 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  22.13 
 
 
602 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  24.38 
 
 
563 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  22.77 
 
 
557 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  22.97 
 
 
602 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  22.97 
 
 
602 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  23.53 
 
 
585 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  23.53 
 
 
585 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  19.39 
 
 
613 aa  69.7  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  22.62 
 
 
609 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  22.43 
 
 
602 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  22.43 
 
 
602 aa  67.4  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  22.75 
 
 
591 aa  66.6  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  21.23 
 
 
584 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  21.23 
 
 
584 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.41 
 
 
653 aa  65.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  23.04 
 
 
602 aa  65.1  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>