152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0784 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  99.66 
 
 
582 aa  1207    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  84.71 
 
 
582 aa  1026    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  100 
 
 
582 aa  1209    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  100 
 
 
582 aa  1209    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  65.8 
 
 
580 aa  781    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  66.67 
 
 
577 aa  785    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  65.1 
 
 
580 aa  774    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  42.33 
 
 
572 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  43.7 
 
 
615 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  41.82 
 
 
621 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  32.58 
 
 
578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  31.06 
 
 
813 aa  287  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  32.18 
 
 
599 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  29.82 
 
 
614 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  29.76 
 
 
615 aa  270  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  30.89 
 
 
621 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  28.45 
 
 
639 aa  263  4.999999999999999e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  29.66 
 
 
642 aa  263  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  31.12 
 
 
601 aa  260  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  29.66 
 
 
642 aa  260  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  28.8 
 
 
629 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  28.67 
 
 
631 aa  259  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  28.85 
 
 
631 aa  258  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  29.48 
 
 
642 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  31.79 
 
 
596 aa  258  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  30.07 
 
 
642 aa  258  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  29.31 
 
 
642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  28.28 
 
 
601 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  31.97 
 
 
613 aa  253  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  32.88 
 
 
616 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  28.29 
 
 
608 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  31.02 
 
 
596 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  30.43 
 
 
594 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  29.56 
 
 
597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  28.48 
 
 
842 aa  237  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  26.77 
 
 
819 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  28.77 
 
 
604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  28.6 
 
 
604 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.87 
 
 
614 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  27.48 
 
 
625 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  27.87 
 
 
614 aa  229  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  26.99 
 
 
635 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  28.87 
 
 
607 aa  226  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  28.91 
 
 
716 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  30.02 
 
 
799 aa  211  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  29.89 
 
 
602 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  29.82 
 
 
1148 aa  197  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  31.74 
 
 
618 aa  196  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  29.56 
 
 
619 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  28.45 
 
 
610 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  28.6 
 
 
610 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  28.45 
 
 
610 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  28.45 
 
 
612 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  28.45 
 
 
610 aa  178  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  26.95 
 
 
617 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  29.82 
 
 
998 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.04 
 
 
612 aa  170  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  25.27 
 
 
592 aa  170  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  25.27 
 
 
592 aa  170  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  28.68 
 
 
615 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  30.52 
 
 
998 aa  167  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.9 
 
 
612 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  30.65 
 
 
991 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  28.07 
 
 
589 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  24.95 
 
 
613 aa  155  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  27.5 
 
 
577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  30.17 
 
 
1153 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  28.04 
 
 
577 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  27.29 
 
 
562 aa  140  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  28.44 
 
 
633 aa  107  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  24.28 
 
 
580 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  24.54 
 
 
580 aa  95.5  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  27.3 
 
 
610 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  24.15 
 
 
613 aa  85.5  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 
655 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  24.9 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  26.9 
 
 
655 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  28.53 
 
 
611 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  26.58 
 
 
601 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  26.61 
 
 
601 aa  80.5  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  24.03 
 
 
810 aa  77.8  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  23.02 
 
 
606 aa  77  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  23.98 
 
 
610 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  24.63 
 
 
818 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  26.19 
 
 
602 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  26.13 
 
 
593 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 
584 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 
584 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  21.05 
 
 
575 aa  75.1  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.27 
 
 
602 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.93 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.93 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.97 
 
 
602 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  25.97 
 
 
574 aa  74.7  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  29.39 
 
 
637 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  27.43 
 
 
645 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  25.36 
 
 
610 aa  73.2  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  24.59 
 
 
584 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  22.61 
 
 
585 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  25.37 
 
 
590 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>