156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0718 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  100 
 
 
613 aa  1255    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  60.87 
 
 
610 aa  734    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  38.17 
 
 
576 aa  357  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  37.41 
 
 
580 aa  356  7.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  38.67 
 
 
586 aa  347  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  34.16 
 
 
586 aa  339  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  36.72 
 
 
584 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  31.9 
 
 
684 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  37.34 
 
 
599 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  39.64 
 
 
519 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  34.17 
 
 
628 aa  272  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  35.7 
 
 
555 aa  259  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  33.44 
 
 
594 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  30.16 
 
 
606 aa  253  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  30.68 
 
 
578 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  30.77 
 
 
601 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  29.84 
 
 
645 aa  218  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  30.02 
 
 
591 aa  217  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.95 
 
 
602 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.73 
 
 
602 aa  201  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  27.24 
 
 
602 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  27.41 
 
 
602 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  27.41 
 
 
602 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  27.24 
 
 
602 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  27.2 
 
 
602 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  30.17 
 
 
611 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  29.95 
 
 
1148 aa  197  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  32.79 
 
 
594 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  30.23 
 
 
608 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  26.73 
 
 
602 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  30.46 
 
 
610 aa  192  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  32.19 
 
 
594 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  25.94 
 
 
810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  28.1 
 
 
593 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  31.31 
 
 
595 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  28.2 
 
 
596 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  27.73 
 
 
584 aa  180  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  27.17 
 
 
609 aa  178  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  27.97 
 
 
601 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  26.19 
 
 
578 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  26.19 
 
 
578 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  29.27 
 
 
672 aa  169  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
588 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  27.25 
 
 
925 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  28.18 
 
 
1153 aa  158  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  24.58 
 
 
818 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  27.31 
 
 
574 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  31.07 
 
 
570 aa  153  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  26.58 
 
 
574 aa  143  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  26.02 
 
 
560 aa  141  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  27.51 
 
 
574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  31.17 
 
 
590 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  31.17 
 
 
590 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  30.41 
 
 
581 aa  130  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  28.24 
 
 
563 aa  117  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  23.51 
 
 
653 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  23.48 
 
 
656 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  23.48 
 
 
656 aa  105  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  25.26 
 
 
580 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.4 
 
 
615 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.08 
 
 
592 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.08 
 
 
592 aa  99  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.85 
 
 
580 aa  99  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.88 
 
 
614 aa  98.6  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  26.88 
 
 
614 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  25.97 
 
 
601 aa  97.8  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  25.74 
 
 
594 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  24.12 
 
 
577 aa  94.4  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  26.96 
 
 
799 aa  94  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  25.24 
 
 
614 aa  93.6  9e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  30.18 
 
 
998 aa  92  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  25.95 
 
 
597 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  30.82 
 
 
991 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.37 
 
 
585 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  22.3 
 
 
608 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  24.88 
 
 
629 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  29.18 
 
 
998 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  26.03 
 
 
562 aa  87  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  24.88 
 
 
631 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  25.83 
 
 
842 aa  86.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  27.57 
 
 
621 aa  85.9  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  23.36 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  25.27 
 
 
621 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  25.21 
 
 
617 aa  85.1  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  23.77 
 
 
582 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.15 
 
 
582 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  24.15 
 
 
582 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  23.36 
 
 
601 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  26.35 
 
 
618 aa  85.1  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  23.83 
 
 
631 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  23.01 
 
 
584 aa  84.7  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  23.01 
 
 
584 aa  84.7  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  25.65 
 
 
619 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26.48 
 
 
577 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  26.32 
 
 
577 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  23.53 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  23.75 
 
 
639 aa  79.7  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  25.46 
 
 
610 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  23.76 
 
 
642 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  25.6 
 
 
596 aa  79.3  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>