126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2538 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  56.35 
 
 
601 aa  693    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  56.51 
 
 
629 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  56.51 
 
 
631 aa  698    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  55.16 
 
 
631 aa  680    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  56.25 
 
 
642 aa  696    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  56.59 
 
 
642 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  56.76 
 
 
642 aa  700    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  99.67 
 
 
604 aa  1258    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  56.76 
 
 
642 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  100 
 
 
604 aa  1263    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  52.08 
 
 
819 aa  651    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  56.42 
 
 
642 aa  693    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  50.59 
 
 
842 aa  620  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  48.47 
 
 
608 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  46.79 
 
 
597 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  46.7 
 
 
635 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  47.25 
 
 
625 aa  581  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  46.01 
 
 
594 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  46.57 
 
 
614 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  46.23 
 
 
613 aa  561  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  46.4 
 
 
614 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  45.1 
 
 
596 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  45.1 
 
 
596 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  45.12 
 
 
607 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  42.6 
 
 
602 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  43.2 
 
 
799 aa  474  1e-132  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  37.25 
 
 
639 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  36.72 
 
 
615 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  35.45 
 
 
813 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  33.51 
 
 
614 aa  332  9e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  33.69 
 
 
601 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  33.27 
 
 
599 aa  287  4e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  30.21 
 
 
621 aa  274  3e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  29.72 
 
 
621 aa  257  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  28.6 
 
 
582 aa  257  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  28.67 
 
 
615 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  30.99 
 
 
616 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  29.13 
 
 
572 aa  249  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.62 
 
 
582 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.6 
 
 
582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  28.6 
 
 
582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  28.3 
 
 
577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.1 
 
 
580 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  28.62 
 
 
580 aa  240  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.74 
 
 
612 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.74 
 
 
612 aa  220  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  27.03 
 
 
716 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  24.23 
 
 
610 aa  217  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  24.28 
 
 
610 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  24.45 
 
 
610 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  24.45 
 
 
612 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.28 
 
 
610 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  26.23 
 
 
578 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  24.92 
 
 
619 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  28.08 
 
 
618 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  27.22 
 
 
617 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.15 
 
 
1148 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  22.74 
 
 
613 aa  178  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25 
 
 
562 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.4 
 
 
592 aa  164  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.4 
 
 
592 aa  164  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  26.15 
 
 
577 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  25.62 
 
 
589 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.3 
 
 
998 aa  156  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  26.08 
 
 
998 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  26.32 
 
 
991 aa  154  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  25.53 
 
 
1153 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.67 
 
 
577 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  23.18 
 
 
615 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  23.81 
 
 
580 aa  94.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.81 
 
 
580 aa  94  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  23.78 
 
 
633 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  23.16 
 
 
563 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  21.73 
 
 
655 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  21.86 
 
 
655 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  18.71 
 
 
588 aa  78.2  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  25 
 
 
925 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  21.35 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  21.73 
 
 
575 aa  75.5  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  21.19 
 
 
637 aa  72  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  24.16 
 
 
584 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  24.16 
 
 
584 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  23.49 
 
 
613 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  20.53 
 
 
611 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  23.53 
 
 
610 aa  65.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  20.78 
 
 
720 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  25.38 
 
 
637 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  21.62 
 
 
578 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  21.62 
 
 
578 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  25.17 
 
 
627 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  22.91 
 
 
585 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  22.91 
 
 
585 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.04 
 
 
656 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.04 
 
 
656 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  22.55 
 
 
606 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  24.26 
 
 
574 aa  57.8  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  21.58 
 
 
610 aa  57  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  23 
 
 
557 aa  56.6  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  23.03 
 
 
640 aa  55.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  21.51 
 
 
608 aa  55.1  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>