134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0658 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  58.16 
 
 		 716 aa  653    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 616 aa  1213    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  44.01 
 
 		 599 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  36.63 
 
 		 813 aa  397  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  39.25 
 
 		 621 aa  395  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  40.95 
 
 		 601 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  37.6 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  33.89 
 
 		 639 aa  349  7e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  38.1 
 
 		 596 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  31.18 
 
 		 615 aa  317  5e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  39.24 
 
 		 615 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  33.33 
 
 		 614 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  33.16 
 
 		 614 aa  310  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  37.5 
 
 		 596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  37.39 
 
 		 594 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  31.92 
 
 		 629 aa  300  5e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  31.97 
 
 		 642 aa  300  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  31.92 
 
 		 631 aa  299  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  33.94 
 
 		 621 aa  299  9e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  31.81 
 
 		 642 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  31.76 
 
 		 601 aa  298  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  31.97 
 
 		 642 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  31.68 
 
 		 642 aa  297  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  38.41 
 
 		 613 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  31.92 
 
 		 631 aa  295  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  32.14 
 
 		 642 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  35.73 
 
 		 842 aa  293  9e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  35.04 
 
 		 597 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  33.39 
 
 		 580 aa  290  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  30.68 
 
 		 608 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  33.57 
 
 		 582 aa  287  2.9999999999999996e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  34.63 
 
 		 635 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  31.32 
 
 		 607 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  30.03 
 
 		 819 aa  284  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  32.16 
 
 		 580 aa  281  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  32.22 
 
 		 577 aa  278  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  30.62 
 
 		 604 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  30.1 
 
 		 572 aa  270  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  32.83 
 
 		 625 aa  268  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  31.69 
 
 		 582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  31.69 
 
 		 582 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  31.69 
 
 		 582 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  30.62 
 
 		 604 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  35.8 
 
 		 602 aa  266  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  27.15 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  33.8 
 
 		 799 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  28.87 
 
 		 618 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  27.1 
 
 		 610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  27.1 
 
 		 612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.1 
 
 		 610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  26.92 
 
 		 610 aa  201  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  32.81 
 
 		 617 aa  200  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  28.62 
 
 		 619 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  26.75 
 
 		 610 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  26.61 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.22 
 
 		 612 aa  193  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.87 
 
 		 612 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  33.5 
 
 		 1153 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  30.78 
 
 		 589 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.98 
 
 		 1148 aa  154  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.9 
 
 		 592 aa  153  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.9 
 
 		 592 aa  153  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  34.82 
 
 		 577 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  28.6 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  33.33 
 
 		 991 aa  135  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  33.26 
 
 		 998 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  28.64 
 
 		 562 aa  127  8.000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  35.2 
 
 		 998 aa  126  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  30.67 
 
 		 577 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  31.74 
 
 		 655 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  30.24 
 
 		 655 aa  94.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.55 
 
 		 613 aa  90.5  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  25.38 
 
 		 580 aa  87.8  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  25.99 
 
 		 580 aa  87  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.8 
 
 		 563 aa  87  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  27.05 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  27.05 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  27.14 
 
 		 610 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  31.67 
 
 		 610 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  27.21 
 
 		 720 aa  80.1  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.99 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.99 
 
 		 656 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  25.58 
 
 		 584 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  29.46 
 
 		 555 aa  74.3  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.41 
 
 		 653 aa  73.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  26.3 
 
 		 633 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  27.66 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  27.62 
 
 		 599 aa  70.5  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  19.9 
 
 		 575 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  26.82 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  19.65 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  21.18 
 
 		 588 aa  67.8  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  22.92 
 
 		 818 aa  67.4  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  24.42 
 
 		 576 aa  66.6  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.27 
 
 		 586 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  29.39 
 
 		 570 aa  64.7  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  25.28 
 
 		 925 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  25.45 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  25.45 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  23.46 
 
 		 810 aa  61.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>