133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01928 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  100 
 
 
576 aa  1170    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  52.95 
 
 
584 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  51.41 
 
 
586 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  45.11 
 
 
586 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  44.15 
 
 
580 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  40.19 
 
 
684 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  38.17 
 
 
613 aa  357  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  38.66 
 
 
610 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  32.9 
 
 
599 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  30.98 
 
 
594 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  31.87 
 
 
628 aa  227  4e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  34.29 
 
 
519 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  34.69 
 
 
555 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.94 
 
 
1148 aa  180  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  31.51 
 
 
611 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  30.67 
 
 
593 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  28.97 
 
 
601 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  30.06 
 
 
578 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  30.89 
 
 
1153 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  25.7 
 
 
606 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  30.06 
 
 
594 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  29.11 
 
 
645 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  28.06 
 
 
578 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  28.06 
 
 
578 aa  148  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  29.9 
 
 
594 aa  148  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  30.94 
 
 
595 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  29.93 
 
 
609 aa  145  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  29.19 
 
 
596 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  28 
 
 
610 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 
591 aa  143  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  26.64 
 
 
602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  26.64 
 
 
602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  27.12 
 
 
602 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  29.49 
 
 
608 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.64 
 
 
602 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.46 
 
 
602 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  26.8 
 
 
602 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  26.43 
 
 
602 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  26.43 
 
 
602 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  25.75 
 
 
810 aa  134  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  28.69 
 
 
570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  25.4 
 
 
584 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  29.35 
 
 
574 aa  121  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  26.81 
 
 
601 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  26.33 
 
 
574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  26.94 
 
 
925 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  25.83 
 
 
574 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  25.78 
 
 
588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  25.6 
 
 
818 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  22.78 
 
 
560 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  30.25 
 
 
581 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.61 
 
 
615 aa  94.7  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  24.83 
 
 
672 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  29.89 
 
 
590 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  29.89 
 
 
590 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.25 
 
 
592 aa  87  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.25 
 
 
592 aa  87  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  24.22 
 
 
601 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26.44 
 
 
577 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  23.54 
 
 
656 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  23.54 
 
 
656 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.01 
 
 
653 aa  77  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.85 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  26.74 
 
 
655 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.71 
 
 
562 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  26.48 
 
 
655 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  28 
 
 
998 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.55 
 
 
998 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  20.94 
 
 
813 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  21.8 
 
 
607 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  25.5 
 
 
577 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  23.19 
 
 
580 aa  65.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  28.44 
 
 
991 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.23 
 
 
585 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  23.46 
 
 
577 aa  64.3  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  26.38 
 
 
589 aa  63.9  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  22.48 
 
 
585 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  22.48 
 
 
585 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  22.72 
 
 
618 aa  63.9  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  21.6 
 
 
582 aa  63.9  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  23.19 
 
 
580 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.22 
 
 
582 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.22 
 
 
582 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  24.22 
 
 
582 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  24.93 
 
 
621 aa  61.6  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  20 
 
 
639 aa  61.2  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  22.55 
 
 
599 aa  60.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  21.9 
 
 
608 aa  60.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  24.33 
 
 
625 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  26.04 
 
 
637 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  23.95 
 
 
617 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  21.64 
 
 
629 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  20.5 
 
 
614 aa  57  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  22.74 
 
 
619 aa  57  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  22.47 
 
 
842 aa  57  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  22.47 
 
 
642 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  20.5 
 
 
614 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  21.56 
 
 
572 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  21.65 
 
 
642 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  22.06 
 
 
642 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>