158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2301 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  100 
 
 
562 aa  1139    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  78.47 
 
 
577 aa  903    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  71.71 
 
 
577 aa  809    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  48.24 
 
 
998 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  48.06 
 
 
998 aa  497  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  48.64 
 
 
991 aa  481  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  40.42 
 
 
615 aa  402  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.18 
 
 
612 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.01 
 
 
612 aa  334  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  32.45 
 
 
610 aa  329  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  32.1 
 
 
610 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  32.1 
 
 
610 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  32.1 
 
 
612 aa  329  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.1 
 
 
610 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  36.15 
 
 
619 aa  316  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  33.1 
 
 
613 aa  309  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  37.79 
 
 
1153 aa  299  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  35.27 
 
 
618 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  34 
 
 
1148 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  31.47 
 
 
617 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  27.65 
 
 
592 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  27.65 
 
 
592 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  35.43 
 
 
589 aa  234  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  27.94 
 
 
614 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  29.9 
 
 
613 aa  180  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  25.45 
 
 
813 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  29.93 
 
 
842 aa  176  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  30.62 
 
 
596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.47 
 
 
604 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  29.06 
 
 
635 aa  170  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  29.84 
 
 
594 aa  170  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  26.34 
 
 
819 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  30.45 
 
 
601 aa  169  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  30.12 
 
 
596 aa  169  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  24.45 
 
 
631 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  29.22 
 
 
599 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  24.25 
 
 
629 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  25.24 
 
 
604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  23.84 
 
 
642 aa  163  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  23.65 
 
 
631 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  25.95 
 
 
642 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  25.95 
 
 
642 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.35 
 
 
614 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  25.35 
 
 
614 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  27.65 
 
 
639 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  30.4 
 
 
577 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  25.55 
 
 
642 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  31.27 
 
 
572 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  27.05 
 
 
625 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  27.22 
 
 
615 aa  156  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  33.33 
 
 
615 aa  156  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  24.6 
 
 
601 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  23.27 
 
 
642 aa  156  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  29.43 
 
 
621 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  31.96 
 
 
621 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  26.07 
 
 
597 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
582 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  29.36 
 
 
580 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.76 
 
 
580 aa  146  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  29.71 
 
 
563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  26.89 
 
 
602 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  25.26 
 
 
607 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.29 
 
 
582 aa  140  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  27.29 
 
 
582 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.1 
 
 
582 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  25.81 
 
 
608 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  26.91 
 
 
799 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  27.14 
 
 
578 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  27.85 
 
 
616 aa  111  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  28.14 
 
 
611 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  30.03 
 
 
716 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  32.43 
 
 
578 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  27.58 
 
 
610 aa  97.1  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  22.6 
 
 
588 aa  95.1  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  23.89 
 
 
633 aa  94  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  28.22 
 
 
584 aa  93.6  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  28.44 
 
 
608 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  27.43 
 
 
587 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  26.03 
 
 
613 aa  87  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  25.84 
 
 
655 aa  87  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  24.04 
 
 
580 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  24.15 
 
 
580 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  29.06 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  29.06 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25.38 
 
 
655 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  25.08 
 
 
602 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  26.38 
 
 
610 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  25.15 
 
 
602 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  25.15 
 
 
602 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  23 
 
 
585 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  23 
 
 
585 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
594 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.15 
 
 
602 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  28.21 
 
 
595 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  26.9 
 
 
594 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.65 
 
 
587 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  22.29 
 
 
602 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  24.62 
 
 
602 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  26.46 
 
 
629 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  23.1 
 
 
606 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>