152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00878 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  100 
 
 		 611 aa  1229    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  54.72 
 
 		 608 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  42.69 
 
 		 1148 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  33.46 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  33.46 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  40.15 
 
 		 1153 aa  250  7e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  30.96 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  27.38 
 
 		 606 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  30.17 
 
 		 613 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  29.28 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  26.47 
 
 		 602 aa  194  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  26.63 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  26.47 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  26.63 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.47 
 
 		 602 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.54 
 
 		 602 aa  186  9e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.8 
 
 		 602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  28.11 
 
 		 591 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  34 
 
 		 570 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  25.25 
 
 		 602 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  32.31 
 
 		 594 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  31.51 
 
 		 576 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  32.53 
 
 		 594 aa  171  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  32.6 
 
 		 601 aa  170  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  30.41 
 
 		 609 aa  170  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  29.34 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  32.31 
 
 		 595 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  33.79 
 
 		 599 aa  165  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  27.43 
 
 		 580 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  30.32 
 
 		 584 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  31.36 
 
 		 593 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  28.69 
 
 		 601 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.54 
 
 		 810 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  29.87 
 
 		 586 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  32.45 
 
 		 610 aa  153  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  32.8 
 
 		 519 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  30.4 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  24.41 
 
 		 818 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  26.03 
 
 		 684 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  28.22 
 
 		 584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  28.48 
 
 		 586 aa  147  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  26.88 
 
 		 574 aa  144  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  32.51 
 
 		 555 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  28.86 
 
 		 590 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  29.22 
 
 		 581 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  28.86 
 
 		 590 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  26.36 
 
 		 574 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  25 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  26.88 
 
 		 574 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  26.14 
 
 		 925 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  30.18 
 
 		 588 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  26.65 
 
 		 628 aa  125  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  26.53 
 
 		 594 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.91 
 
 		 998 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  29.22 
 
 		 998 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  28.14 
 
 		 562 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  28.29 
 
 		 577 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  29.12 
 
 		 991 aa  101  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  24.94 
 
 		 588 aa  99.8  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  29.03 
 
 		 577 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  33.33 
 
 		 672 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.72 
 
 		 563 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  27.25 
 
 		 842 aa  87.8  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  27.35 
 
 		 615 aa  87.8  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  26.6 
 
 		 596 aa  87  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  23.08 
 
 		 585 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  23.08 
 
 		 585 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  21.55 
 
 		 592 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  21.55 
 
 		 592 aa  83.2  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.53 
 
 		 582 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.53 
 
 		 582 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  28.53 
 
 		 582 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.39 
 
 		 653 aa  82.8  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  24.7 
 
 		 619 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.87 
 
 		 580 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  24.38 
 
 		 625 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  28.31 
 
 		 582 aa  80.1  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.02 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  21.91 
 
 		 618 aa  77.4  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  25.44 
 
 		 617 aa  77.4  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.2 
 
 		 656 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.2 
 
 		 656 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  26.53 
 
 		 799 aa  76.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  30.77 
 
 		 587 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  30.31 
 
 		 592 aa  75.5  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  24.18 
 
 		 613 aa  74.7  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  22.19 
 
 		 608 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  22.83 
 
 		 635 aa  74.3  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  23.91 
 
 		 602 aa  72.4  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  27.85 
 
 		 655 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  21.09 
 
 		 615 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.82 
 
 		 610 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.82 
 
 		 610 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.82 
 
 		 610 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.82 
 
 		 612 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  29.57 
 
 		 587 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  22.52 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>