112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2677 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  65.54 
 
 
594 aa  811    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  100 
 
 
628 aa  1294    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  34.17 
 
 
613 aa  272  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  33.94 
 
 
610 aa  269  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  30.68 
 
 
580 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  31.79 
 
 
599 aa  241  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  29.7 
 
 
684 aa  236  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  33.28 
 
 
586 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  31.79 
 
 
586 aa  229  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  31.87 
 
 
576 aa  227  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  31.93 
 
 
584 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  33.26 
 
 
519 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  29.74 
 
 
555 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  28.22 
 
 
593 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.71 
 
 
578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.71 
 
 
578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  29.1 
 
 
609 aa  127  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  25.45 
 
 
606 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  26.65 
 
 
611 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.72 
 
 
1148 aa  123  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  26.61 
 
 
610 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  22.6 
 
 
602 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  25.86 
 
 
596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  26.55 
 
 
594 aa  121  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  23.96 
 
 
602 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  26.79 
 
 
594 aa  120  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  24.4 
 
 
602 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  25.2 
 
 
601 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  23.74 
 
 
602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  23.74 
 
 
602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  27.46 
 
 
595 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  23.96 
 
 
602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  23.74 
 
 
602 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  23.74 
 
 
602 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  26.15 
 
 
591 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  25.32 
 
 
645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  25.72 
 
 
578 aa  114  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  25.42 
 
 
608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  26.83 
 
 
601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  25.71 
 
 
810 aa  110  8.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  25.52 
 
 
1153 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  28.72 
 
 
570 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  26.93 
 
 
581 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  25.89 
 
 
574 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  26.75 
 
 
590 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  26.75 
 
 
590 aa  88.6  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  23.11 
 
 
925 aa  88.6  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  23.25 
 
 
584 aa  86.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  24.64 
 
 
672 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  25.84 
 
 
588 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  24.19 
 
 
818 aa  80.1  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.99 
 
 
653 aa  75.5  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  25.24 
 
 
574 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.61 
 
 
592 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.61 
 
 
592 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.11 
 
 
560 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  25.88 
 
 
574 aa  71.6  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  26.71 
 
 
563 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  24.25 
 
 
615 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  22.97 
 
 
577 aa  63.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.27 
 
 
998 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  29.1 
 
 
614 aa  63.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  24.46 
 
 
655 aa  62  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  24.52 
 
 
577 aa  62  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  23.42 
 
 
720 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  25.69 
 
 
580 aa  61.6  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.85 
 
 
587 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  26.84 
 
 
640 aa  60.8  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.41 
 
 
612 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.97 
 
 
612 aa  60.8  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  28.73 
 
 
615 aa  60.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  24.08 
 
 
655 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.38 
 
 
656 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.38 
 
 
656 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.19 
 
 
998 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  23.53 
 
 
562 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  25.68 
 
 
991 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.08 
 
 
580 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.29 
 
 
610 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.29 
 
 
610 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  22.29 
 
 
610 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.29 
 
 
612 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.29 
 
 
610 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  21.68 
 
 
613 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  23.4 
 
 
637 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  26.09 
 
 
610 aa  53.5  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  20.87 
 
 
588 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  23.67 
 
 
582 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.28 
 
 
577 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  26.5 
 
 
599 aa  51.6  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  24.71 
 
 
615 aa  52  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  27.61 
 
 
600 aa  51.6  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  24.05 
 
 
607 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  26.19 
 
 
813 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  31.91 
 
 
617 aa  48.9  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  23.38 
 
 
639 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  22.25 
 
 
580 aa  48.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  23.84 
 
 
592 aa  47.8  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  25.73 
 
 
546 aa  47.8  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.02 
 
 
582 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>