138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3182 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  63.06 
 
 		 590 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  64.53 
 
 		 581 aa  727    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  63.06 
 
 		 590 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  100 
 
 		 574 aa  1189    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  94.6 
 
 		 574 aa  1134    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  82.02 
 
 		 574 aa  974    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  37.39 
 
 		 925 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  33.5 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  31.2 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  29.34 
 
 		 560 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  30.92 
 
 		 645 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  29.67 
 
 		 606 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  29.74 
 
 		 578 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  29.05 
 
 		 601 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  27.97 
 
 		 602 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  27.3 
 
 		 602 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  26.8 
 
 		 602 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  26.8 
 
 		 602 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  27.3 
 
 		 602 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  27.97 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  27.14 
 
 		 602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  28.31 
 
 		 810 aa  182  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  27.14 
 
 		 602 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.8 
 
 		 602 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  25.13 
 
 		 818 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  30.61 
 
 		 595 aa  170  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  29.77 
 
 		 609 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  27.14 
 
 		 610 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  30.53 
 
 		 596 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  29.27 
 
 		 601 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  29.65 
 
 		 594 aa  163  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  29.44 
 
 		 594 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  28.3 
 
 		 593 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  24.96 
 
 		 672 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  27.31 
 
 		 613 aa  154  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  29.54 
 
 		 570 aa  149  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  30.35 
 
 		 586 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  27.95 
 
 		 608 aa  141  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  23.46 
 
 		 578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  23.46 
 
 		 578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.61 
 
 		 1148 aa  131  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  26.88 
 
 		 611 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  28.24 
 
 		 610 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  24 
 
 		 580 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  26.33 
 
 		 576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  25.24 
 
 		 1153 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  27.71 
 
 		 584 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.5 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  28.03 
 
 		 555 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  27.32 
 
 		 599 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  27.69 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  24.94 
 
 		 684 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.66 
 
 		 580 aa  79.7  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  26.43 
 
 		 572 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.44 
 
 		 580 aa  79  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  25.5 
 
 		 594 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  25.24 
 
 		 628 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.43 
 
 		 577 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  23.2 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.27 
 
 		 998 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  24.31 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  24.31 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.05 
 
 		 991 aa  67  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.45 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.45 
 
 		 582 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  25.96 
 
 		 998 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  24.45 
 
 		 582 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  22.57 
 
 		 588 aa  65.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  25.06 
 
 		 563 aa  64.3  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  23.91 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.46 
 
 		 592 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.46 
 
 		 592 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.94 
 
 		 578 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  23.33 
 
 		 608 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  22.15 
 
 		 585 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  22.15 
 
 		 585 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.64 
 
 		 653 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  23.26 
 
 		 618 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  24.15 
 
 		 582 aa  62.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  22.89 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.09 
 
 		 610 aa  60.8  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.09 
 
 		 610 aa  60.8  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  26.3 
 
 		 599 aa  60.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.09 
 
 		 610 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.09 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  22.82 
 
 		 615 aa  60.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  24.64 
 
 		 577 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  22.75 
 
 		 629 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  22.89 
 
 		 614 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  24.06 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  29.5 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25.23 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  23.63 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  22.8 
 
 		 610 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  28.25 
 
 		 619 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  24.3 
 
 		 604 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  26.2 
 
 		 637 aa  57  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.25 
 
 		 615 aa  57  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  25.07 
 
 		 615 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  24.72 
 
 		 799 aa  56.2  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>