143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1779 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  100 
 
 		 585 aa  1200    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  64.27 
 
 		 585 aa  745    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  64.27 
 
 		 585 aa  745    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  28.6 
 
 		 653 aa  171  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  28.08 
 
 		 656 aa  165  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  28.08 
 
 		 656 aa  165  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  24.49 
 
 		 655 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  24.33 
 
 		 655 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  25.77 
 
 		 720 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  26.56 
 
 		 588 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  24.7 
 
 		 580 aa  119  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  24.48 
 
 		 563 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  25.71 
 
 		 610 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.9 
 
 		 580 aa  113  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  26.1 
 
 		 637 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  21.57 
 
 		 633 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  24.6 
 
 		 557 aa  91.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  21.37 
 
 		 613 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  24.1 
 
 		 560 aa  88.2  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  25.52 
 
 		 998 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  25.22 
 
 		 998 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  22.88 
 
 		 602 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  24.48 
 
 		 606 aa  83.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  22.45 
 
 		 578 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  23.4 
 
 		 991 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  22.17 
 
 		 591 aa  82.4  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  23.42 
 
 		 621 aa  82  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  23.75 
 
 		 602 aa  82  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  22.54 
 
 		 602 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  22.54 
 
 		 602 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  23.06 
 
 		 602 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  23.06 
 
 		 602 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  20.88 
 
 		 595 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  22.55 
 
 		 580 aa  80.1  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  21.25 
 
 		 610 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  23.65 
 
 		 608 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 		 584 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 		 584 aa  79.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  22.06 
 
 		 602 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  22.09 
 
 		 600 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  20.58 
 
 		 1148 aa  77  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  21.5 
 
 		 594 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  21.5 
 
 		 594 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  23.12 
 
 		 577 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  21.96 
 
 		 580 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  21.36 
 
 		 577 aa  75.1  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  20.75 
 
 		 587 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  25.14 
 
 		 615 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  23.46 
 
 		 1153 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  21.73 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  21.73 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  20.79 
 
 		 577 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  21.01 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  22.74 
 
 		 574 aa  73.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.48 
 
 		 592 aa  73.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.48 
 
 		 592 aa  73.6  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  21.85 
 
 		 602 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.92 
 
 		 612 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  22.61 
 
 		 582 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  22.61 
 
 		 582 aa  72  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  22.61 
 
 		 582 aa  72  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  23.82 
 
 		 574 aa  72  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  25.91 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  21.16 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  21.9 
 
 		 570 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  24.32 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  23.2 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  25.89 
 
 		 610 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  22.7 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.87 
 
 		 612 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  24.71 
 
 		 572 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  22.89 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  21.75 
 
 		 602 aa  67.4  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  23.72 
 
 		 610 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  22.09 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  23.41 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  23.41 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  23.42 
 
 		 610 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  22.81 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  21.63 
 
 		 615 aa  65.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  21.72 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  22.44 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  22.85 
 
 		 613 aa  65.1  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  21.23 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  22.29 
 
 		 562 aa  64.7  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  21.33 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  21.59 
 
 		 609 aa  64.3  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  22.96 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  19.52 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.19 
 
 		 612 aa  63.9  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  21.85 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  21.85 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  23.06 
 
 		 640 aa  63.9  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  23.84 
 
 		 813 aa  63.9  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.85 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  20.79 
 
 		 601 aa  63.9  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  21.27 
 
 		 810 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  20.14 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  19.97 
 
 		 592 aa  62.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  21.27 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>