71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8364 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  100 
 
 
545 aa  1069    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  62.39 
 
 
546 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  49.14 
 
 
563 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  37.54 
 
 
600 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  37 
 
 
599 aa  258  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  39.72 
 
 
592 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  42.5 
 
 
640 aa  248  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  40.66 
 
 
587 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  34.44 
 
 
602 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  31.93 
 
 
610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  33.95 
 
 
570 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  30.38 
 
 
587 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  26.73 
 
 
589 aa  80.1  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  26.02 
 
 
627 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  25.91 
 
 
585 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  28.42 
 
 
1153 aa  70.5  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  26.51 
 
 
637 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.38 
 
 
653 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  27.17 
 
 
610 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  24.29 
 
 
588 aa  67.8  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  27.62 
 
 
655 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  24.12 
 
 
584 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  27.33 
 
 
655 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  24.12 
 
 
584 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  28.05 
 
 
637 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  23.3 
 
 
580 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  25.51 
 
 
577 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  24.43 
 
 
610 aa  58.9  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  31.02 
 
 
991 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  28.61 
 
 
578 aa  58.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.14 
 
 
1148 aa  57.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  25.75 
 
 
585 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  25.75 
 
 
585 aa  57  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.3 
 
 
580 aa  56.6  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  25.5 
 
 
629 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 
720 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.17 
 
 
580 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.84 
 
 
562 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  26.52 
 
 
586 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  23.81 
 
 
574 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  22.25 
 
 
615 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  27.17 
 
 
577 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  29.72 
 
 
570 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  21.98 
 
 
656 aa  54.3  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  21.98 
 
 
656 aa  54.3  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  25.13 
 
 
608 aa  53.9  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.19 
 
 
613 aa  53.5  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.85 
 
 
563 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  26.02 
 
 
633 aa  52  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  28.27 
 
 
557 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  23.96 
 
 
580 aa  50.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  26.45 
 
 
584 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  23.42 
 
 
578 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  23.42 
 
 
578 aa  50.4  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  28.25 
 
 
645 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  21.14 
 
 
602 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  21.18 
 
 
575 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  27.73 
 
 
596 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.88 
 
 
998 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.89 
 
 
998 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  27.3 
 
 
584 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  27.08 
 
 
601 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  25 
 
 
577 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  22.8 
 
 
606 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  21.04 
 
 
604 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  26.81 
 
 
615 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  23.47 
 
 
574 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  27.19 
 
 
593 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  23.87 
 
 
574 aa  44.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  25.78 
 
 
594 aa  43.9  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  27.51 
 
 
594 aa  43.5  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>